242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2079 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  366  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  65.05 
 
 		 185 aa  246  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0868  transcriptional regulator, XRE family  46.2 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  45.6 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 180 aa  158  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 184 aa  157  8e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  46.41 
 
 		 180 aa  155  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  41.85 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  35.91 
 
 		 184 aa  111  7.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 185 aa  89  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  32.76 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  31.9 
 
 		 461 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  25.55 
 
 		 460 aa  62.4  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  32.76 
 
 		 461 aa  62  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  30.77 
 
 		 464 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  30.77 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  30.77 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  30.77 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  33.62 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  33.62 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  28.21 
 
 		 464 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  31.09 
 
 		 455 aa  58.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  30.77 
 
 		 464 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1558  putative transcriptional regulator, XRE family  31.62 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  26.76 
 
 		 875 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  31.62 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  29.06 
 
 		 458 aa  54.7  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  46.81 
 
 		 92 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  31.62 
 
 		 465 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  27.43 
 
 		 453 aa  53.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  28.21 
 
 		 464 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  29.31 
 
 		 468 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  25.93 
 
 		 461 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  29.17 
 
 		 456 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  29.31 
 
 		 455 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  30.25 
 
 		 457 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2280  cysteine synthase  27.94 
 
 		 459 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  30.17 
 
 		 463 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1634  CBS  25.66 
 
 		 457 aa  52.8  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  28.21 
 
 		 141 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  26.96 
 
 		 456 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 		 277 aa  52  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  31.09 
 
 		 873 aa  51.6  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  28.8 
 
 		 902 aa  51.6  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.81 
 
 		 453 aa  51.6  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  28.69 
 
 		 282 aa  51.6  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  31.3 
 
 		 142 aa  51.6  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 99 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  27.82 
 
 		 279 aa  50.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  29.06 
 
 		 888 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3340  signal-transduction protein  28.44 
 
 		 385 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  30.33 
 
 		 769 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  28.83 
 
 		 466 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 99 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  28.8 
 
 		 380 aa  49.7  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  27.97 
 
 		 464 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  29.31 
 
 		 456 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  29.06 
 
 		 845 aa  49.3  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  26.09 
 
 		 454 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4086  CBS domain protein  30 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  48 
 
 		 93 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  48.84 
 
 		 90 aa  48.9  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  26.87 
 
 		 279 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 102 aa  48.5  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  28.21 
 
 		 191 aa  48.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  51.06 
 
 		 115 aa  48.5  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 252 aa  48.5  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  27.83 
 
 		 875 aa  48.5  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2553  Cysteine synthase  26.24 
 
 		 457 aa  48.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  26.09 
 
 		 888 aa  48.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0281  CBS  28.83 
 
 		 459 aa  48.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  48.94 
 
 		 90 aa  48.1  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  28.7 
 
 		 875 aa  48.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 134 aa  48.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  25.37 
 
 		 279 aa  48.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  29.82 
 
 		 456 aa  48.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  27.66 
 
 		 147 aa  48.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  28.83 
 
 		 457 aa  47.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3810  signal transduction protein  28.46 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.41 
 
 		 892 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.01 
 
 		 457 aa  47.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  26.72 
 
 		 462 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1696  CBS domain-containing protein  22.22 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000358324  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 		 256 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.83 
 
 		 461 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1154  CBS domain protein  29.23 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2377  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2991  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.83 
 
 		 461 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  42 
 
 		 108 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3011  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  30.07 
 
 		 907 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>