More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3340 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3340  signal-transduction protein  100 
 
 
385 aa  789    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  25.43 
 
 
250 aa  68.9  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  36 
 
 
139 aa  65.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  24.7 
 
 
688 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  29.25 
 
 
879 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  29.25 
 
 
879 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  31.62 
 
 
143 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
485 aa  62  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  31.75 
 
 
139 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  30.41 
 
 
859 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  27.66 
 
 
148 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  33.88 
 
 
138 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  24.86 
 
 
279 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  24.3 
 
 
688 aa  60.1  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.46 
 
 
140 aa  60.1  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  31.11 
 
 
875 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  23.91 
 
 
291 aa  59.7  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  22.77 
 
 
417 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  23.96 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  27.04 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  26.95 
 
 
147 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  23.26 
 
 
399 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  27.97 
 
 
144 aa  57.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.62 
 
 
484 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  24.71 
 
 
413 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  23.81 
 
 
426 aa  56.6  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  28.7 
 
 
310 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1806  KpsF/GutQ family protein  31.9 
 
 
317 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.172857 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.61 
 
 
664 aa  56.2  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  33.33 
 
 
147 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  24.71 
 
 
413 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.13 
 
 
1274 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  24.14 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  27.33 
 
 
185 aa  56.2  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0601  signal transduction protein  24.87 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.35039  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  31.4 
 
 
139 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4731  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 
145 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.48 
 
 
483 aa  55.1  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  26.4 
 
 
769 aa  54.7  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  27.87 
 
 
164 aa  53.9  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13833  predicted protein  23.21 
 
 
443 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0243831  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  22.51 
 
 
153 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  33.67 
 
 
165 aa  53.9  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  20.31 
 
 
380 aa  53.9  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  30.69 
 
 
132 aa  53.5  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  28.69 
 
 
191 aa  53.5  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.09 
 
 
485 aa  53.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  27.91 
 
 
141 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  22.46 
 
 
152 aa  53.1  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  34.33 
 
 
331 aa  53.5  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3089  sensory box protein  18.97 
 
 
858 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.168178  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
873 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  22.96 
 
 
217 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  26.03 
 
 
688 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  22.03 
 
 
315 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  24.37 
 
 
225 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.26 
 
 
873 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  22.52 
 
 
427 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  28.81 
 
 
142 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0768  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.44 
 
 
156 aa  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000458984  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  25 
 
 
862 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  22.51 
 
 
280 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  26.89 
 
 
128 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
491 aa  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 
143 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  35.56 
 
 
145 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 
143 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  32.26 
 
 
153 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1201  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.34 
 
 
485 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.795344  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0664  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.34 
 
 
485 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.116725  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  33.33 
 
 
146 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  34.19 
 
 
131 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1078  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.34 
 
 
485 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.472537  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  30.2 
 
 
230 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  24.35 
 
 
279 aa  51.2  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  30.56 
 
 
236 aa  51.6  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  33.33 
 
 
153 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3740  KpsF/GutQ family protein  29.51 
 
 
391 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  25.63 
 
 
320 aa  51.2  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  28.15 
 
 
143 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.82 
 
 
488 aa  50.8  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
154 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
154 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
154 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  31.11 
 
 
141 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  26.5 
 
 
145 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.05 
 
 
1344 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
154 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  28.89 
 
 
143 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  32.26 
 
 
153 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
154 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  31.78 
 
 
146 aa  50.8  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
154 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
154 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  26.88 
 
 
258 aa  50.8  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  25.58 
 
 
142 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
153 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  20.54 
 
 
427 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  36.05 
 
 
272 aa  50.4  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3746  putative signal transduction protein with CBS domains  27.83 
 
 
144 aa  50.4  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>