More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3740 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3740  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 391 aa  778    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1747  KpsF/GutQ  43.12 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  42.68 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  41.4 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0363  KpsF/GutQ family protein  40.7 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103679  normal  0.93857 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  39.12 
 
 		 326 aa  234  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  40.69 
 
 		 323 aa  233  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  39.94 
 
 		 325 aa  233  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  39.94 
 
 		 325 aa  233  6e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  41.27 
 
 		 331 aa  232  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  39.94 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  42.95 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  41.29 
 
 		 330 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  39.94 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  40.69 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  39.81 
 
 		 332 aa  229  7e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  41.35 
 
 		 326 aa  229  8e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  40.13 
 
 		 325 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  40.69 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0591  KpsF/GutQ family protein  38.7 
 
 		 329 aa  226  6e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000664449  hitchhiker  0.000000000000829793 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4187  KpsF/GutQ family protein  39.12 
 
 		 348 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4212  KpsF/GutQ family protein  39.12 
 
 		 348 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  40.13 
 
 		 326 aa  225  8e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4064  KpsF/GutQ family protein  39.43 
 
 		 348 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  40.5 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1058  KpsF/GutQ family protein  40.62 
 
 		 338 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0691  KpsF/GutQ family protein  39.31 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.983087  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3663  KpsF/GutQ family protein  39.31 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000627199  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  39.23 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0712  KpsF/GutQ family protein  39.31 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0114298 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0721  KpsF/GutQ family protein  39.31 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  41.07 
 
 		 332 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  40.91 
 
 		 329 aa  223  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0720  KpsF/GutQ family protein  38.05 
 
 		 325 aa  222  7e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  39.75 
 
 		 324 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  41.18 
 
 		 326 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  41.8 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  38.14 
 
 		 324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  41.3 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  41.48 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  40.88 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  40.18 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  38.56 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  41.1 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  38.99 
 
 		 325 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  40.99 
 
 		 327 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  38.14 
 
 		 324 aa  220  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  38.8 
 
 		 320 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  41.8 
 
 		 357 aa  219  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  39.12 
 
 		 324 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  38.1 
 
 		 325 aa  219  7e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  38.99 
 
 		 325 aa  219  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  39.43 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  38.68 
 
 		 325 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  40 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  44.07 
 
 		 341 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3418  KpsF/GutQ  42.06 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000032508  normal  0.585789 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  42.94 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  40 
 
 		 330 aa  217  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0404  KpsF/GutQ family protein  38.78 
 
 		 323 aa  217  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.126623 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  39.63 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  42.94 
 
 		 327 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1114  arabinose 5-phosphate isomerase  38.78 
 
 		 320 aa  216  5e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  42.94 
 
 		 327 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  42.94 
 
 		 327 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  42.94 
 
 		 327 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  42.94 
 
 		 327 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  42.94 
 
 		 327 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  42.63 
 
 		 327 aa  215  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  42.07 
 
 		 325 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  37.62 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  43.25 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  40 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  37.46 
 
 		 330 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  37.11 
 
 		 345 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  42.77 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  39.43 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  40 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  37.62 
 
 		 328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  40 
 
 		 324 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  40.65 
 
 		 325 aa  213  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  41.27 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  37.3 
 
 		 328 aa  212  9e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  37.3 
 
 		 328 aa  212  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  37.3 
 
 		 328 aa  212  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  37.3 
 
 		 328 aa  212  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  37.3 
 
 		 328 aa  212  9e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  37.3 
 
 		 328 aa  212  9e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  37.46 
 
 		 325 aa  212  9e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  37.3 
 
 		 328 aa  212  9e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  37.3 
 
 		 328 aa  212  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  38.36 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2308  KpsF/GutQ family protein  39.94 
 
 		 333 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0307  KpsF/GutQ family protein  43.21 
 
 		 327 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  40.95 
 
 		 329 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  43.21 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  39.23 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  40.06 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  39.13 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  39.13 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>