More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2162 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 331 aa  672    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  43.33 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  43.87 
 
 		 329 aa  261  8.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  43.03 
 
 		 328 aa  259  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  41.3 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  43.95 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  44.59 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  44.44 
 
 		 328 aa  249  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  46.67 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  47.39 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  46.13 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  46.13 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  46.3 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  45.09 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.69 
 
 		 356 aa  242  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  45.78 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  46.75 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  45.19 
 
 		 337 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  45.31 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  44.87 
 
 		 362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  44.87 
 
 		 337 aa  235  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  44.87 
 
 		 337 aa  235  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  44.87 
 
 		 328 aa  235  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  41.62 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  40.29 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  46.1 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  37.33 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  46.1 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  46.1 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  46.1 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  46.1 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  46.1 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  46.1 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  46.1 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  43.71 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  39.89 
 
 		 360 aa  229  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  39.55 
 
 		 370 aa  228  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.91 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  39.03 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  37.82 
 
 		 375 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  38.97 
 
 		 368 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  37.85 
 
 		 372 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  38.75 
 
 		 368 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  37.78 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.51 
 
 		 346 aa  219  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  40.91 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  42.9 
 
 		 331 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  37.88 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  36.99 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  40.74 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  39.05 
 
 		 378 aa  209  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  38.7 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  39.59 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  38.56 
 
 		 323 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  36.73 
 
 		 351 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  40.38 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  36.94 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  37.18 
 
 		 323 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  36.2 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.27 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  35.22 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  37.14 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  40.26 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  43.81 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  36.2 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  30.43 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  39.18 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  29.83 
 
 		 395 aa  156  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  34.94 
 
 		 358 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  30.2 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  42.77 
 
 		 190 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  29.28 
 
 		 378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  29.1 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  34.97 
 
 		 349 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  35.5 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0757  divalent cation transport protein  38.24 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000343665 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  42.68 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  35.18 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  33.72 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  34.43 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  35.94 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  34.15 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  35 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  35.43 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  33.66 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  30.05 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  30.99 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  34.9 
 
 		 367 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30.99 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  30.05 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  33.49 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  34.38 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  39.16 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  34.68 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  39.88 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  34.02 
 
 		 324 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  35.26 
 
 		 357 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  32.74 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  34.87 
 
 		 345 aa  99.4  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0818  cobalamin synthesis protein, P47K  32.43 
 
 		 381 aa  99.4  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.110941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>