More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1017 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0272  peptidase M41, FtsH  53.53 
 
 
639 aa  653    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520053  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
633 aa  1294    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  49.84 
 
 
646 aa  579  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  48.69 
 
 
617 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.52 
 
 
618 aa  567  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.68 
 
 
636 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.03 
 
 
639 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.44 
 
 
617 aa  560  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.44 
 
 
650 aa  560  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.997433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1012  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.66 
 
 
616 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2393  FtsH peptidase  47.69 
 
 
619 aa  558  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00023499  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  49.75 
 
 
637 aa  560  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3248  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.28 
 
 
616 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  47.71 
 
 
665 aa  558  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.85 
 
 
646 aa  555  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  47.52 
 
 
614 aa  555  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.58 
 
 
607 aa  554  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.59 
 
 
621 aa  554  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.57 
 
 
637 aa  551  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  49.14 
 
 
649 aa  550  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.6 
 
 
656 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.47 
 
 
676 aa  550  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.9 
 
 
651 aa  551  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.56 
 
 
652 aa  551  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2884  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.86 
 
 
623 aa  549  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402765  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  48.97 
 
 
644 aa  548  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  48.17 
 
 
616 aa  545  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.8 
 
 
659 aa  548  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.26 
 
 
647 aa  546  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.94 
 
 
671 aa  548  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.35 
 
 
647 aa  545  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  46.7 
 
 
608 aa  545  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.97 
 
 
612 aa  544  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.47 
 
 
662 aa  545  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.8 
 
 
612 aa  542  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  47.73 
 
 
660 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.15 
 
 
657 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  47.45 
 
 
693 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.14 
 
 
634 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  45.44 
 
 
617 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.83 
 
 
640 aa  538  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.54 
 
 
647 aa  541  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  45.28 
 
 
617 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  47.56 
 
 
658 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  46.59 
 
 
652 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.81 
 
 
637 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.27 
 
 
641 aa  538  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.13 
 
 
643 aa  537  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.81 
 
 
634 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.28 
 
 
615 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.97 
 
 
637 aa  536  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  47.14 
 
 
642 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.81 
 
 
634 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  45.31 
 
 
617 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.86 
 
 
640 aa  537  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  47.53 
 
 
659 aa  537  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.2 
 
 
650 aa  536  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.99 
 
 
645 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  49.4 
 
 
602 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  46.27 
 
 
641 aa  538  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  46.47 
 
 
639 aa  535  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  47.14 
 
 
639 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  46.53 
 
 
651 aa  533  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  45.74 
 
 
634 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.34 
 
 
659 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.99 
 
 
652 aa  534  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.94 
 
 
651 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  48.28 
 
 
640 aa  533  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.68 
 
 
640 aa  535  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.81 
 
 
635 aa  535  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.12 
 
 
638 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  47.69 
 
 
647 aa  532  1e-150  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.75 
 
 
643 aa  534  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.19 
 
 
640 aa  532  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.29 
 
 
638 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.45 
 
 
638 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.21 
 
 
638 aa  533  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.88 
 
 
627 aa  532  1e-150  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.59 
 
 
630 aa  532  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000142168  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.21 
 
 
643 aa  533  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.35 
 
 
642 aa  534  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.18 
 
 
673 aa  533  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.78 
 
 
647 aa  531  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  47.23 
 
 
647 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  46.63 
 
 
638 aa  531  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.24 
 
 
652 aa  531  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  45.74 
 
 
634 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  47.78 
 
 
647 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.37 
 
 
635 aa  528  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  47.61 
 
 
647 aa  530  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.01 
 
 
631 aa  531  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.76 
 
 
617 aa  531  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  47.78 
 
 
647 aa  531  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.68 
 
 
657 aa  528  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  45.15 
 
 
619 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  47.24 
 
 
643 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  47.4 
 
 
647 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  47.78 
 
 
647 aa  531  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  47.78 
 
 
644 aa  531  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  46.07 
 
 
764 aa  531  1e-149  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>