More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf613 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf613  5'-3' exonuclease, exo domain of DNA polymerase I  100 
 
 		 293 aa  591  1e-168  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0636  DNA polymerase I  40.2 
 
 		 911 aa  194  2e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.2885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  40.86 
 
 		 877 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  37.46 
 
 		 936 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  40.47 
 
 		 877 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  40.47 
 
 		 877 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  38.01 
 
 		 877 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  40.47 
 
 		 877 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  40.08 
 
 		 891 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  40.08 
 
 		 891 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  40.08 
 
 		 891 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  40.08 
 
 		 877 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  40.08 
 
 		 877 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl582  DNA polymerase I  37.67 
 
 		 895 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0335993  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  39.3 
 
 		 877 aa  182  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  39.13 
 
 		 876 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  38.58 
 
 		 872 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  37.65 
 
 		 936 aa  179  5.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  37.02 
 
 		 878 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  36.15 
 
 		 950 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  38.74 
 
 		 888 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  35.88 
 
 		 893 aa  172  6.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  38.74 
 
 		 878 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  37.93 
 
 		 972 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  37.93 
 
 		 972 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  35.57 
 
 		 868 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  38.19 
 
 		 904 aa  170  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  35.37 
 
 		 944 aa  169  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  38.82 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 932 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 932 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 932 aa  169  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0543  DNA polymerase I  35.29 
 
 		 1024 aa  168  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72991  normal  0.283494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  36.11 
 
 		 1273 aa  168  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  34.95 
 
 		 894 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  37.31 
 
 		 953 aa  168  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  36.93 
 
 		 876 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  34.35 
 
 		 908 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  37.15 
 
 		 877 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  36.93 
 
 		 876 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  35.91 
 
 		 903 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  38.49 
 
 		 896 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  35.79 
 
 		 902 aa  166  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0459  Exo  37.45 
 
 		 289 aa  166  5e-40  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.454696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  37.13 
 
 		 982 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  34.01 
 
 		 843 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  37.7 
 
 		 883 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  35.15 
 
 		 870 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  39.06 
 
 		 873 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  36.86 
 
 		 876 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  36.39 
 
 		 963 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  40.08 
 
 		 880 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  34.12 
 
 		 930 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  37.7 
 
 		 850 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1500  5'-3' exonuclease  34.22 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1529  5'-3' exonuclease  34.22 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  37.15 
 
 		 943 aa  163  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  36.43 
 
 		 946 aa  163  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  35.02 
 
 		 903 aa  163  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  35.02 
 
 		 903 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0546  DNA polymerase I  36.99 
 
 		 1045 aa  162  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1012  5'-3' exonuclease, putative  35.04 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.667651  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  35.27 
 
 		 924 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  37.01 
 
 		 906 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  35.18 
 
 		 917 aa  162  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  37.74 
 
 		 846 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  33.56 
 
 		 949 aa  161  9e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1316  5'-3' exonuclease  37.02 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000236171  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1079  DNA polymerase I  36.73 
 
 		 836 aa  161  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.26558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  32.89 
 
 		 901 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  33.67 
 
 		 901 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  34.01 
 
 		 910 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  34.29 
 
 		 928 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  33.99 
 
 		 895 aa  159  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  34.48 
 
 		 929 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  37.39 
 
 		 891 aa  159  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  31.99 
 
 		 912 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  34.77 
 
 		 866 aa  159  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1643  5'-3' exonuclease family protein  35.9 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0209002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  37.01 
 
 		 866 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3702  5'-3' exonuclease family protein  35.9 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00175288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  32.4 
 
 		 939 aa  158  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  35.38 
 
 		 928 aa  158  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  34.6 
 
 		 932 aa  158  8e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 929 aa  158  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  33.77 
 
 		 888 aa  158  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  35.38 
 
 		 928 aa  158  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  35.38 
 
 		 928 aa  158  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  35.38 
 
 		 928 aa  158  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  35.38 
 
 		 928 aa  158  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1504  5'-3' exonuclease  34.36 
 
 		 288 aa  158  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  35.38 
 
 		 928 aa  158  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  35.38 
 
 		 928 aa  158  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  35.38 
 
 		 928 aa  158  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1675  5'-3' exonuclease family protein  35.04 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1489  5'-3' exonuclease family protein  35.04 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1462  5'-3' exonuclease  35.04 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1606  5'-3' exonuclease family protein  35.04 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.368882  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  34.23 
 
 		 894 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  37.01 
 
 		 866 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>