103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02594 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02594  possible polysaccharide export protein  100 
 
 		 493 aa  976    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  37.43 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 502 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 493 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  25.21 
 
 		 448 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 		 500 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 500 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  25.78 
 
 		 483 aa  87.8  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 		 507 aa  87.4  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  23.03 
 
 		 493 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  27.05 
 
 		 465 aa  85.9  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 497 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  28.03 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  23.8 
 
 		 492 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  23.12 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  23.12 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  23.39 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  23.53 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  25.4 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 507 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  23.26 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  23.26 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 488 aa  77  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  21.93 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  21.93 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  22.07 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  21.93 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  23.43 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  21.93 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  28.29 
 
 		 482 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 		 500 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  18.43 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  21.46 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 502 aa  69.7  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  20.23 
 
 		 501 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  23.98 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  25.59 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  21.3 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  21.69 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  27.24 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  21.02 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 		 486 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  19.17 
 
 		 476 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  21.45 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  25.66 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  21.45 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 487 aa  63.9  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  25.08 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  21.67 
 
 		 501 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  21.54 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  22.83 
 
 		 508 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  21.54 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  22.29 
 
 		 497 aa  57  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  23.05 
 
 		 500 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  20.07 
 
 		 492 aa  55.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  25.1 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  22.13 
 
 		 489 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  20.2 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 514 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  22.83 
 
 		 479 aa  53.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  21.81 
 
 		 508 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 		 502 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  21.49 
 
 		 504 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  23.35 
 
 		 467 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 		 504 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  22.26 
 
 		 520 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  23.95 
 
 		 506 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 509 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 503 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 		 490 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 		 575 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  21.82 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 515 aa  48.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2913  polysaccharide biosynthesis protein  23.01 
 
 		 458 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.953336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2377  polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 		 446 aa  47  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 494 aa  46.6  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  26.71 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 490 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 		 483 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  24.27 
 
 		 505 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>