86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00864 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  100 
 
 		 278 aa  575  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  41.26 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  40.45 
 
 		 279 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  36.67 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  36.3 
 
 		 291 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  36.16 
 
 		 287 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  34.93 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  35.42 
 
 		 284 aa  188  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  35.53 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  34.69 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  36.3 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  30.74 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  33.96 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  31.72 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  32.84 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  31.72 
 
 		 295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  32.45 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  31.32 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  31.09 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  30.99 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  30.71 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  29.07 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  30.86 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  29.74 
 
 		 285 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  28.35 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  27.9 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  30.15 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  30.15 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  30.15 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  26.88 
 
 		 287 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  30.42 
 
 		 276 aa  122  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  29.93 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  25.72 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  26.57 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04050  hypothetical protein  41.32 
 
 		 122 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280957  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1781  hypothetical protein  29.46 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  33.05 
 
 		 295 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  27.38 
 
 		 294 aa  106  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  27 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2014  hypothetical protein  27.13 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  25.98 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  28.33 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  28.69 
 
 		 299 aa  98.6  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  23.72 
 
 		 312 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0419  hypothetical protein  29.1 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3177  hypothetical protein  28.28 
 
 		 305 aa  95.9  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2028  hypothetical protein  28.95 
 
 		 290 aa  92  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000322678  normal  0.839611 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3596  hypothetical protein  28.17 
 
 		 288 aa  92.4  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  27.27 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01226  hypothetical protein  28.98 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6931  hypothetical protein  26.12 
 
 		 313 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2140  hypothetical protein  28.99 
 
 		 290 aa  89.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  27.87 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4208  hypothetical protein  27.13 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4812  hypothetical protein  27.56 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  31.47 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1442  hypothetical protein  25.7 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.37014  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3185  transcriptional regulator-like  27.4 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2190  hypothetical protein  25.09 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.315226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  23.04 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35.23 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  28.99 
 
 		 351 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  23.85 
 
 		 326 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.33 
 
 		 327 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  24.57 
 
 		 323 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 231 aa  46.2  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  30.43 
 
 		 663 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  29.41 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.33 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  29.41 
 
 		 699 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  35.16 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  31.33 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4005  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  28.16 
 
 		 229 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  26.36 
 
 		 351 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2673  hypothetical protein  36.36 
 
 		 698 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.749079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.94 
 
 		 315 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4133  DeoR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 317 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113991  normal  0.040793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  19.64 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  30.77 
 
 		 320 aa  42.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0676  hypothetical protein  27.21 
 
 		 206 aa  42.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.268937  hitchhiker  0.000000172919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  32.5 
 
 		 336 aa  42  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>