More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6624 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 433 aa  873    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  66.92 
 
 		 432 aa  537  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  66.92 
 
 		 435 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  65.17 
 
 		 435 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  64.93 
 
 		 435 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  55.59 
 
 		 458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  44.69 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  44.95 
 
 		 468 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  46.74 
 
 		 370 aa  341  1e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  46.59 
 
 		 365 aa  312  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  44.38 
 
 		 405 aa  265  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  44.74 
 
 		 405 aa  254  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  39.82 
 
 		 369 aa  252  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  44.66 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  38.9 
 
 		 392 aa  246  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  37.78 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  35.94 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  36.19 
 
 		 398 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  39.77 
 
 		 388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  36.78 
 
 		 349 aa  223  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  34.42 
 
 		 344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  35.36 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  37.39 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  31.95 
 
 		 365 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  36.39 
 
 		 375 aa  197  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  35.46 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  36.16 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  35.19 
 
 		 384 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  35.19 
 
 		 384 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  38.12 
 
 		 374 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  37.83 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  33.62 
 
 		 362 aa  187  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 		 385 aa  180  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  34.5 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  34.1 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  32.06 
 
 		 357 aa  156  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  32.84 
 
 		 384 aa  152  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  32.75 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  30.26 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  33.24 
 
 		 357 aa  141  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  30.33 
 
 		 330 aa  137  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  29.97 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 331 aa  126  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  32.35 
 
 		 336 aa  126  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 		 337 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 334 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  32.56 
 
 		 349 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  29.33 
 
 		 369 aa  120  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 		 324 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.15 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  34.82 
 
 		 338 aa  117  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 337 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  30.64 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 		 667 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  31.96 
 
 		 335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 340 aa  114  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 		 325 aa  113  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 330 aa  113  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.77 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 667 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  33.45 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 336 aa  109  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  32.51 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  29.3 
 
 		 329 aa  106  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  27.59 
 
 		 328 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  29.62 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  27.43 
 
 		 347 aa  104  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  31.02 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  29.94 
 
 		 328 aa  104  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  27.22 
 
 		 343 aa  104  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.06 
 
 		 328 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2780  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 		 395 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779998  normal  0.106115 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4959  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 		 395 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.114649 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.94 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  37.22 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  27.69 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.87 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.76 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 		 327 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  26.65 
 
 		 396 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 		 373 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.05 
 
 		 362 aa  100  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  27.86 
 
 		 343 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  27.37 
 
 		 353 aa  99.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  31 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  26.11 
 
 		 326 aa  99  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  31.23 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  29.5 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 		 334 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.27 
 
 		 333 aa  98.2  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 		 328 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>