197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5538 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5538  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  263  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  74.22 
 
 
312 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  79.03 
 
 
310 aa  191  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  65.6 
 
 
310 aa  177  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  62.7 
 
 
310 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  68.85 
 
 
308 aa  159  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  66.39 
 
 
310 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  61.9 
 
 
315 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  62.99 
 
 
312 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  64.23 
 
 
309 aa  147  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  60.98 
 
 
310 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  60.8 
 
 
313 aa  144  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  60.16 
 
 
310 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  60.16 
 
 
310 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  60.16 
 
 
310 aa  144  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  59.35 
 
 
310 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  59.35 
 
 
310 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  57.03 
 
 
310 aa  141  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  62.7 
 
 
310 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  62.7 
 
 
310 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  62.7 
 
 
310 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  62.7 
 
 
310 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  62.7 
 
 
310 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  62.7 
 
 
310 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  54.33 
 
 
310 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  62.61 
 
 
307 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  52.5 
 
 
310 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  57.26 
 
 
310 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  56.1 
 
 
309 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  61.48 
 
 
309 aa  132  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  60 
 
 
309 aa  132  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  54.92 
 
 
334 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  56.56 
 
 
311 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  60 
 
 
311 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  64.91 
 
 
309 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  59.02 
 
 
310 aa  131  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  55.28 
 
 
308 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  61.21 
 
 
306 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  53.17 
 
 
314 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  56.56 
 
 
310 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  57.94 
 
 
310 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  52 
 
 
321 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1933  hypothetical protein  57.48 
 
 
129 aa  123  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00663582  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  59.48 
 
 
306 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  55.65 
 
 
311 aa  121  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  57.72 
 
 
309 aa  120  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  52.38 
 
 
309 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  51.67 
 
 
311 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  55.47 
 
 
310 aa  117  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  56.1 
 
 
309 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  53.91 
 
 
310 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  53.6 
 
 
310 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  50.4 
 
 
310 aa  110  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  47.86 
 
 
305 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  54.4 
 
 
310 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  47.54 
 
 
326 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  45.61 
 
 
273 aa  103  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  47.54 
 
 
310 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  45.22 
 
 
272 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  47.54 
 
 
310 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  39.26 
 
 
294 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  39.26 
 
 
294 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  43.7 
 
 
295 aa  98.2  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  41.04 
 
 
297 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  44.35 
 
 
272 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  38.52 
 
 
294 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  38.52 
 
 
294 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  40.3 
 
 
297 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  38.52 
 
 
301 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  43.48 
 
 
272 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  48.18 
 
 
321 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  40 
 
 
292 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  40.74 
 
 
293 aa  92  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  43.48 
 
 
272 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  40.3 
 
 
299 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  38.85 
 
 
300 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  39.13 
 
 
289 aa  84.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  40.44 
 
 
303 aa  84  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  41.18 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  41.48 
 
 
309 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  37.23 
 
 
300 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  37.23 
 
 
300 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  34.59 
 
 
298 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  40.74 
 
 
309 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  40.74 
 
 
309 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  40.74 
 
 
309 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  40.74 
 
 
309 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  40.74 
 
 
309 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  38.52 
 
 
294 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  40.74 
 
 
309 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  40.74 
 
 
309 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  40 
 
 
312 aa  80.5  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  40.74 
 
 
309 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  40.74 
 
 
309 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  39.55 
 
 
295 aa  80.5  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  36.03 
 
 
293 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  40.74 
 
 
309 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  40 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  39.26 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  40 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>