More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3521 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3521  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  460  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2467  ABC transporter related  58.4 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.766044  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  61.57 
 
 		 234 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  60.43 
 
 		 239 aa  278  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5163  ABC transporter related  59.74 
 
 		 236 aa  278  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.726387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4074  ABC transporter related  58.01 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0007  ABC transporter related  57.58 
 
 		 234 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678223 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  56.72 
 
 		 237 aa  275  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  57.51 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  58.44 
 
 		 234 aa  274  7e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  57.98 
 
 		 237 aa  274  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  57.83 
 
 		 234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  58.72 
 
 		 237 aa  272  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  56.52 
 
 		 234 aa  271  9e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  57.83 
 
 		 230 aa  270  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  57.51 
 
 		 241 aa  268  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3048  ABC transporter related  59.31 
 
 		 251 aa  268  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3330  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.73 
 
 		 251 aa  268  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  58.87 
 
 		 251 aa  268  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  58.87 
 
 		 239 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  60.87 
 
 		 243 aa  267  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3266  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  58.44 
 
 		 251 aa  266  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  57.08 
 
 		 241 aa  266  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  60.87 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  56.52 
 
 		 234 aa  266  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  58.3 
 
 		 239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0102  ABC transporter related  58.87 
 
 		 251 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2971  ABC transporter related  58.87 
 
 		 251 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0084  ABC transporter related  58.87 
 
 		 251 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3914  ABC transporter related  57.58 
 
 		 252 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  58.44 
 
 		 251 aa  264  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0018  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.58 
 
 		 252 aa  264  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  58.44 
 
 		 251 aa  264  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  56.65 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4066  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.85 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.85 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0199  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding subunit  58.85 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1608  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3538  ABC transporter related  56.02 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3376  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3212  ABC transporter related  56.02 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2993  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  56.52 
 
 		 237 aa  262  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  56.84 
 
 		 238 aa  261  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3343  ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  56.09 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  54.35 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  54.04 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  56.52 
 
 		 244 aa  258  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  56.52 
 
 		 244 aa  258  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  56.52 
 
 		 246 aa  258  8e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  52.7 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  54.35 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0937  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.81 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  51.95 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3781  ABC transporter related  55.7 
 
 		 245 aa  252  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  52.61 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  52.61 
 
 		 248 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  55.22 
 
 		 242 aa  251  7e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  51.74 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  52.17 
 
 		 232 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  51.3 
 
 		 232 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  51.04 
 
 		 241 aa  240  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  51.3 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  51.3 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  51.93 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  51.3 
 
 		 233 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  50.62 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  48.26 
 
 		 230 aa  228  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  47.84 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1802  ABC transporter related  49.57 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.639319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  48.92 
 
 		 246 aa  208  6e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.01 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1792  ABC transporter related  47.83 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000519176 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  45.89 
 
 		 236 aa  201  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  45.45 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  49.12 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  49.13 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  45.02 
 
 		 252 aa  197  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  43.1 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  47.83 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.82 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  43.64 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  46.64 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  46.64 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  48.33 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  44.87 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  41.45 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  44.87 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  47.87 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  47.87 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  46.02 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  43.72 
 
 		 233 aa  191  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  46.35 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.16 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  45.89 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  45.89 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  46.09 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  43.93 
 
 		 240 aa  189  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  46.09 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>