123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2256 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2256  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
240 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.404984  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0353  heat shock protein DnaJ domain protein  76.23 
 
 
241 aa  279  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3329  heat shock protein DnaJ-like  50.62 
 
 
245 aa  207  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2421  heat shock protein DnaJ-like  49.36 
 
 
261 aa  201  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4778  hypothetical protein  49.79 
 
 
238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2392  heat shock protein DnaJ-like  49.38 
 
 
244 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3059  heat shock protein DnaJ-like  50.84 
 
 
242 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0751  heat shock protein DnaJ domain protein  47.77 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000868694 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3560  heat shock protein DnaJ domain protein  50.82 
 
 
242 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665124  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5342  heat shock protein DnaJ domain protein  51.1 
 
 
231 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1700  heat shock protein DnaJ  52.97 
 
 
298 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.20246  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1671  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.13 
 
 
250 aa  169  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.984207  normal  0.27085 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5266  heat shock protein DnaJ domain protein  59.86 
 
 
231 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4799  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  59.86 
 
 
231 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.111411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4540  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.53 
 
 
242 aa  158  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0499659  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1370  heat shock protein DnaJ-like  58.06 
 
 
231 aa  151  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0791  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  55.78 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.267414 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2148  heat shock protein DnaJ-like  37.71 
 
 
252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1396  DnaJ domain-containing protein  48.99 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2499  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.45 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86775  normal  0.0662441 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1860  aconitate hydratase 2  29.58 
 
 
235 aa  94  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3491  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52 
 
 
168 aa  79  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1074  DnaJ domain-containing protein  53.57 
 
 
102 aa  74.7  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0316124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2790  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  57.58 
 
 
130 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1072  DnaJ domain-containing protein  50 
 
 
56 aa  65.9  0.0000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0676389  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0801  heat shock protein DnaJ, N-terminal  37.8 
 
 
140 aa  64.3  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0201  dnaJ domain-containing protein  50.91 
 
 
79 aa  63.9  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.138312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3891  heat shock protein DnaJ domain protein  39.47 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.717519 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0818  DnaJ domain-containing protein  40.35 
 
 
128 aa  57.8  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3147  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.24 
 
 
141 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.144632 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3317  heat shock protein DnaJ-like  52.73 
 
 
98 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0976  heat shock protein DnaJ-like  46.55 
 
 
256 aa  52.4  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.156674  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1195  heat shock protein DnaJ domain protein  52.08 
 
 
248 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1489  putative heat shock protein DnaJ  41.38 
 
 
216 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45043  predicted protein  47.37 
 
 
153 aa  49.7  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251497  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6456  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  55.81 
 
 
325 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00677011 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02230  chaperone, putative  48 
 
 
97 aa  49.3  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0113448  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01941  putative heat shock protein DnaJ  39.66 
 
 
217 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38616  predicted protein  46.3 
 
 
111 aa  48.5  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.126504  normal  0.22468 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04559  Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim14 (Presequence translocated-associated motor subunit pam18) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4H1]  46.55 
 
 
105 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_8096  predicted protein  41.51 
 
 
67 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0730  heat shock protein DnaJ domain protein  39.06 
 
 
276 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01371  putative heat shock protein DnaJ  44.19 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.333222 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06170  DnaJ domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08300)  50 
 
 
418 aa  45.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.281227 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_42151  predicted protein  38.3 
 
 
402 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2736  heat shock protein DnaJ-like  41.82 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0900  putative chaperone protein DnaJ  37.74 
 
 
383 aa  44.7  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
387 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
387 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
382 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1089  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.33 
 
 
116 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2044  DnaJ domain protein  47.92 
 
 
502 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.265464  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0133  DnaJ domain-containing protein  47.92 
 
 
502 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.805655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1017  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.33 
 
 
116 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1465  heat shock protein DnaJ domain protein  50 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00965011  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0616  putative chaperonin  24.59 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  42.5 
 
 
297 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  46 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0370  chaperone protein DnaJ  35.48 
 
 
372 aa  44.3  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.980316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3554  chaperone protein DnaJ  33.87 
 
 
388 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.562407  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  54.84 
 
 
326 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1905  hypothetical protein  30.56 
 
 
185 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  46.51 
 
 
373 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3109  Dna-J like membrane chaperone protein  24.4 
 
 
262 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  48.57 
 
 
373 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  36.07 
 
 
385 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1422  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.5 
 
 
309 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000419249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  42.5 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5925  heat shock protein DnaJ domain protein  41.46 
 
 
279 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0916  heat shock protein DnaJ-like  52.94 
 
 
170 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0211  chaperone protein DnaJ  47.22 
 
 
385 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0335  heat shock protein DnaJ-like protein  33.86 
 
 
153 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  24.4 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  24.4 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_19643  predicted protein  34.92 
 
 
423 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0479063  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_9940  predicted protein  44.9 
 
 
60 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0433566 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0995  Dna-J like membrane chaperone protein  25.11 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.15 
 
 
339 aa  43.5  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  25.57 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1670  chaperone protein DnaJ  45.95 
 
 
382 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.890746  normal  0.0271561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0431  ferredoxin  40.82 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  31.15 
 
 
373 aa  43.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3852  heat shock protein DnaJ domain protein  56.25 
 
 
179 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0403992  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0339  heat shock protein DnaJ-like  44.19 
 
 
196 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2225  heat shock protein DnaJ domain protein  39.71 
 
 
182 aa  43.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.316967  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.52 
 
 
260 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58189  mitochondrial chaperonin of the DnaJ family  37.1 
 
 
145 aa  43.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1645  chaperone protein DnaJ  35.48 
 
 
383 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0266103  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0536  heat shock protein DnaJ domain protein  59.38 
 
 
193 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3800  heat shock protein DnaJ domain protein  56.25 
 
 
179 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4394  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000485596  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  31.48 
 
 
336 aa  42.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0100  heat shock protein DnaJ-like protein  41.18 
 
 
257 aa  42.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2865  Dna-J like membrane chaperone protein  53.12 
 
 
284 aa  42.7  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787957  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0087  chaperone protein DnaJ  43.24 
 
 
373 aa  42.7  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.60044  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0675  heat shock protein  39.53 
 
 
276 aa  42.7  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.745295  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
372 aa  42.7  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4446  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0804  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000435348  decreased coverage  1.53546e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4432  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000040586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>