40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1860 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1860  aconitate hydratase 2  100 
 
 		 235 aa  481  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2148  heat shock protein DnaJ-like  34.38 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2499  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.72 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86775  normal  0.0662441 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1396  DnaJ domain-containing protein  36.05 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3059  heat shock protein DnaJ-like  33.33 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3560  heat shock protein DnaJ domain protein  34.25 
 
 		 242 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665124  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2256  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.5 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.404984  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4540  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.49 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0499659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2392  heat shock protein DnaJ-like  32.1 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3329  heat shock protein DnaJ-like  30.05 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1700  heat shock protein DnaJ  34.78 
 
 		 298 aa  82  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.20246  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0751  heat shock protein DnaJ domain protein  32.21 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000868694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0353  heat shock protein DnaJ domain protein  33.94 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2421  heat shock protein DnaJ-like  31.6 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4778  hypothetical protein  27.98 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5342  heat shock protein DnaJ domain protein  32.54 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5266  heat shock protein DnaJ domain protein  32.81 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4799  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.59 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.111411 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3491  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.48 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1671  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.37 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.984207  normal  0.27085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1370  heat shock protein DnaJ-like  28.83 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0818  DnaJ domain-containing protein  39.33 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0801  heat shock protein DnaJ, N-terminal  37.04 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0791  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.267414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2790  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.17 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0201  dnaJ domain-containing protein  43.86 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.138312  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3147  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.06 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.144632 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3891  heat shock protein DnaJ domain protein  25 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.717519 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3317  heat shock protein DnaJ-like  39.73 
 
 		 98 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1074  DnaJ domain-containing protein  41.07 
 
 		 102 aa  53.5  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0316124  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02230  chaperone, putative  40 
 
 		 97 aa  51.2  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0113448  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38616  predicted protein  44 
 
 		 111 aa  50.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.126504  normal  0.22468 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45043  predicted protein  44.78 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251497  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04559  Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim14 (Presequence translocated-associated motor subunit pam18) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4H1]  49.06 
 
 		 105 aa  46.2  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1072  DnaJ domain-containing protein  35.29 
 
 		 56 aa  45.8  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0676389  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04250  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  60.61 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0096  chaperone DnaJ domain protein  37.5 
 
 		 310 aa  43.9  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.274204 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  32.58 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_8096  predicted protein  40 
 
 		 67 aa  42.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0018  DnaJ domain protein  30.39 
 
 		 292 aa  42.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>