289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_0018 on replicon NC_010657
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010657  SbBS512_0018  DnaJ domain protein  100 
 
 
292 aa  611  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0023  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20200  hypothetical protein  33.79 
 
 
164 aa  99.8  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0277717  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0025  DnaJ domain protein  42.11 
 
 
147 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.77205  normal  0.0848501 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04192  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05900)  36.05 
 
 
634 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.107548  normal  0.45593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  45.33 
 
 
298 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  49.09 
 
 
395 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0942  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  46.43 
 
 
377 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.122373  normal  0.06017 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  44.64 
 
 
383 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85654  yeast dnaJ homolog (nuclear envelope protein) heat shock protein  46.94 
 
 
404 aa  51.2  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.351399  normal  0.0803186 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
384 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  52.17 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0025  chaperone protein DnaJ  43.1 
 
 
380 aa  50.8  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0145  chaperone protein DnaJ  45.61 
 
 
376 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813386  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  37.68 
 
 
297 aa  50.4  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  36.36 
 
 
374 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0461  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
381 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2956  chaperone protein DnaJ  48.28 
 
 
382 aa  50.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  48.98 
 
 
388 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  37.66 
 
 
387 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  37.66 
 
 
387 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
385 aa  49.7  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2999  chaperone protein DnaJ  45.61 
 
 
395 aa  49.7  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.905644  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84519  Molecular chaperone (DnaJ superfamily)  49.06 
 
 
344 aa  49.3  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35649  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf297  heat shock protein DnaJ  42.31 
 
 
369 aa  49.3  0.00007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.302595  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1454  chaperone protein DnaJ  35.44 
 
 
368 aa  49.3  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02238  DnaJ domain protein Psi, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07340)  48 
 
 
377 aa  48.9  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542195  normal  0.0811515 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  50 
 
 
375 aa  48.9  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1511  chaperone protein DnaJ  35.44 
 
 
368 aa  48.9  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.577618  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  37.8 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0005  chaperone protein DnaJ  43.1 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  49.09 
 
 
395 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0589  heat shock protein DnaJ domain protein  34.15 
 
 
347 aa  48.9  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00109481  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  34.44 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31961  dnaJ homolog in endoplasmic reticulum  34.18 
 
 
374 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  35.37 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01120  chaperone regulator, putative  40.68 
 
 
361 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  34.62 
 
 
379 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1691  chaperone protein DnaJ  49.09 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.211452  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1487  chaperone protein DnaJ  45 
 
 
382 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.992778  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
374 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
373 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
377 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1582  chaperone protein DnaJ  47.27 
 
 
395 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 
386 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  26.79 
 
 
369 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  42.86 
 
 
356 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0918  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
377 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.343225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3835  chaperone protein DnaJ  46.94 
 
 
382 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.504584  hitchhiker  0.000855612 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1855  dnaJ protein  40.35 
 
 
377 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
381 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
382 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
374 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
380 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2470  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
380 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  48.21 
 
 
297 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  36.14 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2732  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
374 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000152871  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  29.63 
 
 
385 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  37.18 
 
 
381 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
359 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
374 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0039  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
377 aa  47  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553213  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  33.77 
 
 
376 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5455  chaperone protein DnaJ  46.94 
 
 
389 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  37.97 
 
 
336 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0619  chaperone protein DnaJ  46 
 
 
392 aa  47  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1776  chaperone protein DnaJ  46.94 
 
 
383 aa  46.6  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4504  dnaJ protein  40.35 
 
 
380 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3228  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.44 
 
 
93 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.862412  normal  0.903575 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  45 
 
 
394 aa  46.6  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2499  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.24 
 
 
253 aa  47  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86775  normal  0.0662441 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
377 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0034  chaperone protein DnaJ  40.68 
 
 
378 aa  47  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.953723  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0767  chaperone protein DnaJ  39.71 
 
 
379 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0511  chaperone protein DnaJ  48.98 
 
 
378 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.100964  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 
356 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  38.67 
 
 
296 aa  46.6  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3554  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
388 aa  46.6  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.562407  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  42 
 
 
380 aa  46.6  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
377 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  47.92 
 
 
296 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
397 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1422  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 
400 aa  46.2  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.234078  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3455  chaperone protein DnaJ  47.92 
 
 
381 aa  46.2  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
377 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  44 
 
 
335 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0730  heat shock protein DnaJ domain protein  40.32 
 
 
276 aa  46.2  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
375 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1467  heat shock protein DnaJ-like  41.67 
 
 
229 aa  45.8  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0609571  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  44 
 
 
335 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  31.65 
 
 
339 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.6 
 
 
334 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  41.94 
 
 
384 aa  45.8  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
377 aa  45.8  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0143  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.33 
 
 
297 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000524271  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
381 aa  45.8  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  44.64 
 
 
388 aa  45.8  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>