92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3059 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_3059  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 
242 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3329  heat shock protein DnaJ-like  80.99 
 
 
245 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2392  heat shock protein DnaJ-like  86.67 
 
 
244 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3560  heat shock protein DnaJ domain protein  85.12 
 
 
242 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665124  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2421  heat shock protein DnaJ-like  72.73 
 
 
261 aa  355  5e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4778  hypothetical protein  72.27 
 
 
238 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1700  heat shock protein DnaJ  69.55 
 
 
298 aa  293  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.20246  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4540  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.93 
 
 
242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0499659  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0353  heat shock protein DnaJ domain protein  53.12 
 
 
241 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2256  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  58.78 
 
 
240 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.404984  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0751  heat shock protein DnaJ domain protein  44.8 
 
 
243 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000868694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1671  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.23 
 
 
250 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.984207  normal  0.27085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1370  heat shock protein DnaJ-like  51.3 
 
 
231 aa  138  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2499  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.22 
 
 
253 aa  138  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86775  normal  0.0662441 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5342  heat shock protein DnaJ domain protein  42.18 
 
 
231 aa  132  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5266  heat shock protein DnaJ domain protein  48.67 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4799  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.33 
 
 
231 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.111411 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2148  heat shock protein DnaJ-like  44.19 
 
 
252 aa  122  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0791  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.16 
 
 
253 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.267414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1396  DnaJ domain-containing protein  47.83 
 
 
222 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1860  aconitate hydratase 2  29.51 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3491  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.05 
 
 
168 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1074  DnaJ domain-containing protein  52.73 
 
 
102 aa  71.2  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0316124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2790  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.73 
 
 
130 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0801  heat shock protein DnaJ, N-terminal  45.16 
 
 
140 aa  67  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0818  DnaJ domain-containing protein  45.76 
 
 
128 aa  65.1  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0201  dnaJ domain-containing protein  48.33 
 
 
79 aa  64.7  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.138312  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1072  DnaJ domain-containing protein  47.27 
 
 
56 aa  61.2  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0676389  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3891  heat shock protein DnaJ domain protein  49.09 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.717519 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_8096  predicted protein  49.06 
 
 
67 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0976  heat shock protein DnaJ-like  50 
 
 
256 aa  52.8  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.156674  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1489  putative heat shock protein DnaJ  38.6 
 
 
216 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38616  predicted protein  48.15 
 
 
111 aa  52.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.126504  normal  0.22468 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1195  heat shock protein DnaJ domain protein  47.06 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45043  predicted protein  47.37 
 
 
153 aa  51.6  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251497  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02230  chaperone, putative  48.15 
 
 
97 aa  51.2  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0113448  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01941  putative heat shock protein DnaJ  36.84 
 
 
217 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3147  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.17 
 
 
141 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.144632 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  48.08 
 
 
326 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3317  heat shock protein DnaJ-like  44 
 
 
98 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  31.13 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6456  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.29 
 
 
325 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00677011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0868  Dna-J like membrane chaperone protein  29.35 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3306  Dna-J like membrane chaperone protein  35.87 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044478  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00670  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  41.51 
 
 
321 aa  43.9  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.772796  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5925  heat shock protein DnaJ domain protein  50 
 
 
279 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04559  Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim14 (Presequence translocated-associated motor subunit pam18) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4H1]  41.82 
 
 
105 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0307  hypothetical protein  48.57 
 
 
361 aa  43.9  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  42.86 
 
 
309 aa  43.9  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4007  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.7 
 
 
253 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4050  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.16235e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4538  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000345209  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4446  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0335  heat shock protein DnaJ-like protein  39.66 
 
 
153 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3374  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.34 
 
 
347 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4212  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000364555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4335  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7152000000000002e-45 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01371  putative heat shock protein DnaJ  44.68 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.333222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4394  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000485596  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0020  Dna-J like membrane chaperone protein  48.57 
 
 
276 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.13 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  52.83 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  34.44 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5081  heat shock protein DnaJ domain protein  42.86 
 
 
196 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.181728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1089  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.33 
 
 
116 aa  43.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_42151  predicted protein  37.74 
 
 
402 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06170  DnaJ domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08300)  55.88 
 
 
418 aa  43.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.281227 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4432  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000040586  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
382 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.43 
 
 
315 aa  43.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
387 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
387 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1017  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.33 
 
 
116 aa  43.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0804  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000435348  decreased coverage  1.53546e-22 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3633  Dna-J like membrane chaperone protein  34.44 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3554  chaperone protein DnaJ  34.92 
 
 
388 aa  42.7  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.562407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4164  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
368 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000033123  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2075  Dna-J like membrane chaperone protein  25.14 
 
 
270 aa  42.7  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000570933  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1052  Dna-J like membrane chaperone protein  34.44 
 
 
262 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0982922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0983  Dna-J like membrane chaperone protein  34.44 
 
 
262 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.193447  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  33.33 
 
 
262 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0900  putative chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 
383 aa  42.4  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3176  heat shock protein DnaJ domain protein  38.46 
 
 
367 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.444736  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  45.95 
 
 
297 aa  42  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2813  Dna-J like membrane chaperone protein  38.64 
 
 
256 aa  42  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603068  normal  0.639961 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4917  heat shock protein DnaJ, N-terminal  35.59 
 
 
341 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34896  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0444  DnaJ-class molecular chaperone  41.18 
 
 
381 aa  41.6  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.771058  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  33.33 
 
 
262 aa  41.6  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  45.95 
 
 
297 aa  41.6  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0730  heat shock protein DnaJ domain protein  37.1 
 
 
276 aa  42  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0970  Dna-J like membrane chaperone protein  34.85 
 
 
259 aa  41.6  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0207673  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>