61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4540 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4540  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
242 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0499659  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2421  heat shock protein DnaJ-like  46.59 
 
 
261 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3329  heat shock protein DnaJ-like  47.81 
 
 
245 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4778  hypothetical protein  44.53 
 
 
238 aa  174  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1700  heat shock protein DnaJ  56.95 
 
 
298 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.20246  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3059  heat shock protein DnaJ-like  43.9 
 
 
242 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2392  heat shock protein DnaJ-like  43.19 
 
 
244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3560  heat shock protein DnaJ domain protein  45.63 
 
 
242 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665124  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0751  heat shock protein DnaJ domain protein  39.04 
 
 
243 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000868694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1671  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.08 
 
 
250 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.984207  normal  0.27085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0353  heat shock protein DnaJ domain protein  50.22 
 
 
241 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2256  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  54.61 
 
 
240 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.404984  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1370  heat shock protein DnaJ-like  45.45 
 
 
231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5342  heat shock protein DnaJ domain protein  42.53 
 
 
231 aa  126  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4799  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.03 
 
 
231 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.111411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5266  heat shock protein DnaJ domain protein  44.44 
 
 
231 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0791  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.23 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.267414 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2499  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
253 aa  113  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86775  normal  0.0662441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2148  heat shock protein DnaJ-like  42.86 
 
 
252 aa  109  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1396  DnaJ domain-containing protein  44.51 
 
 
222 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1860  aconitate hydratase 2  32.05 
 
 
235 aa  87  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3491  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.96 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2790  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  56.36 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3891  heat shock protein DnaJ domain protein  38.05 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.717519 
 
 
-
 
NC_002978  WD1074  DnaJ domain-containing protein  46.55 
 
 
102 aa  63.9  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0316124  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0801  heat shock protein DnaJ, N-terminal  43.55 
 
 
140 aa  64.3  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0201  dnaJ domain-containing protein  45.61 
 
 
79 aa  60.8  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.138312  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0976  heat shock protein DnaJ-like  50 
 
 
256 aa  55.8  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.156674  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_8096  predicted protein  45.45 
 
 
67 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1072  DnaJ domain-containing protein  39.29 
 
 
56 aa  53.9  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0676389  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0818  DnaJ domain-containing protein  33.85 
 
 
128 aa  53.5  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45043  predicted protein  45.76 
 
 
153 aa  52.8  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251497  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38616  predicted protein  48.15 
 
 
111 aa  50.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.126504  normal  0.22468 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02230  chaperone, putative  42.42 
 
 
97 aa  49.7  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0113448  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3317  heat shock protein DnaJ-like  42.86 
 
 
98 aa  48.5  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1489  putative heat shock protein DnaJ  38.89 
 
 
216 aa  48.5  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04559  Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim14 (Presequence translocated-associated motor subunit pam18) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4H1]  51.72 
 
 
105 aa  48.5  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1195  heat shock protein DnaJ domain protein  45.1 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3147  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.1 
 
 
141 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.144632 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  45.1 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1805  heat shock protein DnaJ domain protein  50 
 
 
186 aa  46.2  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58189  mitochondrial chaperonin of the DnaJ family  41.67 
 
 
145 aa  46.2  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01941  putative heat shock protein DnaJ  38.89 
 
 
217 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6456  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.81 
 
 
325 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00677011 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0307  hypothetical protein  28.05 
 
 
361 aa  45.8  0.0006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0730  heat shock protein DnaJ domain protein  42.19 
 
 
276 aa  45.4  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2225  heat shock protein DnaJ domain protein  50 
 
 
182 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.316967  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.4 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  35.29 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.29 
 
 
317 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.29 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.29 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0370  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
372 aa  44.3  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.980316  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  41.43 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  47.22 
 
 
316 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3697  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.88 
 
 
208 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700158 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2884  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.83 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842041  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  40.38 
 
 
313 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  35.85 
 
 
291 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04199  DnaJ domain protein  37.66 
 
 
109 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1969  heat shock protein DnaJ domain protein  34.88 
 
 
258 aa  42  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>