41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3891 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3891  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 
237 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.717519 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2148  heat shock protein DnaJ-like  42.31 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1396  DnaJ domain-containing protein  54.55 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2499  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.98 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86775  normal  0.0662441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3329  heat shock protein DnaJ-like  28.51 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1370  heat shock protein DnaJ-like  47.06 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4540  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.05 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0499659  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0353  heat shock protein DnaJ domain protein  50 
 
 
241 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2256  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.47 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.404984  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2392  heat shock protein DnaJ-like  38.46 
 
 
244 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1700  heat shock protein DnaJ  38.32 
 
 
298 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.20246  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2421  heat shock protein DnaJ-like  40.38 
 
 
261 aa  58.9  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4778  hypothetical protein  49.09 
 
 
238 aa  58.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38616  predicted protein  46.67 
 
 
111 aa  58.5  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.126504  normal  0.22468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3491  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.51 
 
 
168 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1671  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.67 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.984207  normal  0.27085 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0751  heat shock protein DnaJ domain protein  35.96 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000868694 
 
 
-
 
NC_002978  WD1074  DnaJ domain-containing protein  47.37 
 
 
102 aa  58.5  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0316124  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0801  heat shock protein DnaJ, N-terminal  40.85 
 
 
140 aa  57  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3059  heat shock protein DnaJ-like  49.09 
 
 
242 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3560  heat shock protein DnaJ domain protein  49.09 
 
 
242 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665124  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1860  aconitate hydratase 2  25 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0201  dnaJ domain-containing protein  42.86 
 
 
79 aa  53.5  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.138312  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_8096  predicted protein  44.07 
 
 
67 aa  52.4  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2790  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.09 
 
 
130 aa  52  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58189  mitochondrial chaperonin of the DnaJ family  40.32 
 
 
145 aa  51.6  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5342  heat shock protein DnaJ domain protein  36.28 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02230  chaperone, putative  44.07 
 
 
97 aa  51.6  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0113448  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0818  DnaJ domain-containing protein  38.18 
 
 
128 aa  50.8  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5266  heat shock protein DnaJ domain protein  42.86 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4799  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.86 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.111411 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45043  predicted protein  34.94 
 
 
153 aa  50.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251497  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0791  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.45 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.267414 
 
 
-
 
NC_002978  WD1072  DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
56 aa  48.5  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0676389  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04559  Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim14 (Presequence translocated-associated motor subunit pam18) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4H1]  37.93 
 
 
105 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3317  heat shock protein DnaJ-like  37.18 
 
 
98 aa  45.8  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3147  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
141 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.144632 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1767  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46 
 
 
384 aa  42.7  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0730  heat shock protein DnaJ domain protein  31.75 
 
 
276 aa  42.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  42.59 
 
 
258 aa  42  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0976  heat shock protein DnaJ-like  42 
 
 
256 aa  42  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.156674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>