77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4778 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4778  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3329  heat shock protein DnaJ-like  75.63 
 
 
245 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2421  heat shock protein DnaJ-like  70.64 
 
 
261 aa  333  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2392  heat shock protein DnaJ-like  71.97 
 
 
244 aa  321  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3560  heat shock protein DnaJ domain protein  73.11 
 
 
242 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3059  heat shock protein DnaJ-like  71.85 
 
 
242 aa  308  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1700  heat shock protein DnaJ  65.68 
 
 
298 aa  259  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.20246  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4540  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.27 
 
 
242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0499659  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0353  heat shock protein DnaJ domain protein  52.91 
 
 
241 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0751  heat shock protein DnaJ domain protein  46.91 
 
 
243 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000868694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2256  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  57.82 
 
 
240 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.404984  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1370  heat shock protein DnaJ-like  52.29 
 
 
231 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1671  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.87 
 
 
250 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.984207  normal  0.27085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5342  heat shock protein DnaJ domain protein  39.42 
 
 
231 aa  125  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2499  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.2 
 
 
253 aa  121  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86775  normal  0.0662441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2148  heat shock protein DnaJ-like  44.94 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0791  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.97 
 
 
253 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.267414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5266  heat shock protein DnaJ domain protein  45.21 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1396  DnaJ domain-containing protein  46.62 
 
 
222 aa  113  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4799  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.21 
 
 
231 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.111411 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1860  aconitate hydratase 2  28.4 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3491  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.86 
 
 
168 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1074  DnaJ domain-containing protein  50.91 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0316124  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0201  dnaJ domain-containing protein  52.63 
 
 
79 aa  67  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.138312  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0801  heat shock protein DnaJ, N-terminal  40.85 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0818  DnaJ domain-containing protein  46.43 
 
 
128 aa  63.5  0.000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2790  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  54.24 
 
 
130 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1072  DnaJ domain-containing protein  45.45 
 
 
56 aa  59.7  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0676389  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3891  heat shock protein DnaJ domain protein  49.09 
 
 
237 aa  58.9  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.717519 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38616  predicted protein  49.12 
 
 
111 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.126504  normal  0.22468 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0976  heat shock protein DnaJ-like  52 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.156674  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45043  predicted protein  49.12 
 
 
153 aa  54.3  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251497  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02230  chaperone, putative  48.21 
 
 
97 aa  53.1  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0113448  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1195  heat shock protein DnaJ domain protein  47.06 
 
 
248 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_8096  predicted protein  49.06 
 
 
67 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1489  putative heat shock protein DnaJ  40.74 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  34.91 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3147  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.27 
 
 
141 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.144632 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  44.64 
 
 
309 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01941  putative heat shock protein DnaJ  38.89 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  0.790247 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04559  Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim14 (Presequence translocated-associated motor subunit pam18) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4H1]  43.64 
 
 
105 aa  47  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  48.89 
 
 
326 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  55.56 
 
 
292 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3317  heat shock protein DnaJ-like  39.62 
 
 
98 aa  45.4  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
387 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1089  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.33 
 
 
116 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1017  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.33 
 
 
116 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4394  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000485596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4212  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000364555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4335  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7152000000000002e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4050  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.16235e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4446  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1465  heat shock protein DnaJ domain protein  40.74 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00965011  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00670  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  41.51 
 
 
321 aa  43.9  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.772796  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4538  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000345209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
387 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4164  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
368 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000033123  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0730  heat shock protein DnaJ domain protein  38.71 
 
 
276 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2225  heat shock protein DnaJ domain protein  39.34 
 
 
182 aa  43.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.316967  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1718  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.33 
 
 
153 aa  43.5  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.82766  normal  0.111433 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2303  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
384 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0682598  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.43 
 
 
315 aa  43.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4432  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000040586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0804  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000435348  decreased coverage  1.53546e-22 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0164  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
377 aa  42.7  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
382 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2529  chaperone protein DnaJ  39.29 
 
 
379 aa  42.7  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2736  heat shock protein DnaJ-like  54.84 
 
 
201 aa  42  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3323  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  54.55 
 
 
643 aa  42.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.429446  normal  0.119258 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0452  heat shock protein DnaJ domain protein  44.23 
 
 
209 aa  42.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0307  hypothetical protein  44.74 
 
 
361 aa  42  0.008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0444  DnaJ-class molecular chaperone  41.18 
 
 
381 aa  42  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.771058  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
373 aa  42  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6456  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.29 
 
 
325 aa  42  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00677011 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0527  chaperone protein DnaJ  41.86 
 
 
364 aa  41.6  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
385 aa  41.6  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>