178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0751 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0751  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 
243 aa  484  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000868694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1671  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.21 
 
 
250 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.984207  normal  0.27085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0353  heat shock protein DnaJ domain protein  52.89 
 
 
241 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2421  heat shock protein DnaJ-like  46.09 
 
 
261 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3329  heat shock protein DnaJ-like  44.22 
 
 
245 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4778  hypothetical protein  46.06 
 
 
238 aa  168  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3059  heat shock protein DnaJ-like  43.95 
 
 
242 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2256  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  56.08 
 
 
240 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.404984  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2392  heat shock protein DnaJ-like  43.78 
 
 
244 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3560  heat shock protein DnaJ domain protein  41.53 
 
 
242 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665124  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1700  heat shock protein DnaJ  46.43 
 
 
298 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.20246  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5342  heat shock protein DnaJ domain protein  43.2 
 
 
231 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4540  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.5 
 
 
242 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0499659  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2499  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.33 
 
 
253 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86775  normal  0.0662441 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5266  heat shock protein DnaJ domain protein  46.58 
 
 
231 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4799  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.89 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.111411 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1370  heat shock protein DnaJ-like  39.04 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2148  heat shock protein DnaJ-like  41.18 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1396  DnaJ domain-containing protein  42.04 
 
 
222 aa  106  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0791  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.95 
 
 
253 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.267414 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1860  aconitate hydratase 2  27.38 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3491  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.44 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2790  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.88 
 
 
130 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0201  dnaJ domain-containing protein  42.11 
 
 
79 aa  59.3  0.00000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.138312  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1074  DnaJ domain-containing protein  36.76 
 
 
102 aa  58.2  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0316124  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3891  heat shock protein DnaJ domain protein  35.96 
 
 
237 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.717519 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0801  heat shock protein DnaJ, N-terminal  42.86 
 
 
140 aa  57.8  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0976  heat shock protein DnaJ-like  50 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.156674  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1072  DnaJ domain-containing protein  39.29 
 
 
56 aa  52.8  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0676389  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3317  heat shock protein DnaJ-like  42.19 
 
 
98 aa  52.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0818  DnaJ domain-containing protein  34.48 
 
 
128 aa  52.4  0.000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38616  predicted protein  44.44 
 
 
111 aa  52.4  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.126504  normal  0.22468 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1195  heat shock protein DnaJ domain protein  46.15 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
380 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0133  DnaJ domain-containing protein  47.17 
 
 
502 aa  48.9  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.805655  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3554  chaperone protein DnaJ  45 
 
 
388 aa  49.3  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.562407  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2044  DnaJ domain protein  47.17 
 
 
502 aa  48.9  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.265464  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45043  predicted protein  43.86 
 
 
153 aa  48.9  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251497  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4394  chaperone protein DnaJ  44.64 
 
 
371 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000485596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4212  chaperone protein DnaJ  44.64 
 
 
371 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000364555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4050  chaperone protein DnaJ  44.64 
 
 
371 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.16235e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  44.64 
 
 
371 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4335  chaperone protein DnaJ  44.64 
 
 
371 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7152000000000002e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4538  chaperone protein DnaJ  44.64 
 
 
371 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000345209  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  41.07 
 
 
309 aa  47.8  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4446  chaperone protein DnaJ  44.64 
 
 
371 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.05 
 
 
268 aa  47.8  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2781  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  48 
 
 
258 aa  47  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  43.86 
 
 
298 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0370  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
372 aa  47.8  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.980316  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  41.38 
 
 
381 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6456  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50 
 
 
325 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00677011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.23 
 
 
324 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1089  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.27 
 
 
116 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1017  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.27 
 
 
116 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 
382 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
388 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_8096  predicted protein  41.51 
 
 
67 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  41.07 
 
 
379 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  41.07 
 
 
379 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1420  heat shock protein DnaJ domain protein  40.35 
 
 
191 aa  46.2  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4432  chaperone protein DnaJ  44.64 
 
 
371 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000040586  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00670  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  39.62 
 
 
321 aa  46.6  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.772796  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0804  chaperone protein DnaJ  44.64 
 
 
371 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000435348  decreased coverage  1.53546e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4164  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
368 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000033123  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02230  chaperone, putative  45.28 
 
 
97 aa  46.2  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0113448  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
376 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2303  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
384 aa  46.2  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0682598  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  41.07 
 
 
373 aa  45.8  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1489  putative heat shock protein DnaJ  36.84 
 
 
216 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  38.46 
 
 
336 aa  45.8  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0451  chaperone protein DnaJ  43.64 
 
 
375 aa  45.8  0.0006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06170  DnaJ domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08300)  42.59 
 
 
418 aa  45.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.281227 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  41.07 
 
 
366 aa  45.4  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0675  heat shock protein  38.6 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.745295  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  42.31 
 
 
385 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0730  heat shock protein DnaJ domain protein  34.38 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2529  chaperone protein DnaJ  41.07 
 
 
379 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  45.28 
 
 
378 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  47.17 
 
 
379 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0285  chaperone DnaJ domain protein  44.83 
 
 
319 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
382 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04559  Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim14 (Presequence translocated-associated motor subunit pam18) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4H1]  44.44 
 
 
105 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 
375 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  42.31 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl414  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
374 aa  43.9  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 
370 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  43.86 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0211  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
385 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  38.46 
 
 
326 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  39.29 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1065  DnaJ domain-containing protein  42 
 
 
298 aa  43.9  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0527  chaperone protein DnaJ  35.71 
 
 
364 aa  44.3  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01941  putative heat shock protein DnaJ  35.09 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  43.86 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2225  heat shock protein DnaJ domain protein  41.82 
 
 
182 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.316967  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1003  heat shock protein DnaJ domain protein  42.11 
 
 
311 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35 
 
 
339 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  47.17 
 
 
337 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  42.31 
 
 
378 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>