73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2790 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2790  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
130 aa  243  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1700  heat shock protein DnaJ  52.11 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.20246  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4540  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  56.36 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0499659  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3059  heat shock protein DnaJ-like  51.39 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2421  heat shock protein DnaJ-like  54.24 
 
 
261 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2256  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  55.71 
 
 
240 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.404984  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1370  heat shock protein DnaJ-like  51.43 
 
 
231 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3560  heat shock protein DnaJ domain protein  55.93 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665124  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2392  heat shock protein DnaJ-like  55.93 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3329  heat shock protein DnaJ-like  54.24 
 
 
245 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5342  heat shock protein DnaJ domain protein  54.29 
 
 
231 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0751  heat shock protein DnaJ domain protein  46.88 
 
 
243 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000868694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4778  hypothetical protein  57.41 
 
 
238 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0791  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  57.63 
 
 
253 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.267414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0353  heat shock protein DnaJ domain protein  52.11 
 
 
241 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3491  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.54 
 
 
168 aa  62  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1671  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.32 
 
 
250 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.984207  normal  0.27085 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2148  heat shock protein DnaJ-like  51.79 
 
 
252 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3317  heat shock protein DnaJ-like  47.37 
 
 
98 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5266  heat shock protein DnaJ domain protein  55.93 
 
 
231 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4799  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  55.93 
 
 
231 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.111411 
 
 
-
 
NC_002978  WD1074  DnaJ domain-containing protein  46.43 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0316124  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3147  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.11 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.144632 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1860  aconitate hydratase 2  47.17 
 
 
235 aa  57.4  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2499  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
253 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86775  normal  0.0662441 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1396  DnaJ domain-containing protein  48.28 
 
 
222 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0818  DnaJ domain-containing protein  44.44 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1072  DnaJ domain-containing protein  49.02 
 
 
56 aa  52.8  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0676389  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_8096  predicted protein  42.37 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3891  heat shock protein DnaJ domain protein  49.09 
 
 
237 aa  52  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.717519 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0801  heat shock protein DnaJ, N-terminal  44 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0201  dnaJ domain-containing protein  36.51 
 
 
79 aa  50.1  0.000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.138312  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  50.94 
 
 
201 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0730  heat shock protein DnaJ domain protein  40.32 
 
 
276 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0976  heat shock protein DnaJ-like  46.94 
 
 
256 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.156674  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02230  chaperone, putative  42.37 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0113448  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6456  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.17 
 
 
325 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00677011 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04250  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  40.98 
 
 
282 aa  44.7  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04310  chaperone regulator, putative  44.44 
 
 
404 aa  44.7  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00566214  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0496  co-chaperone protein DnaJ  40 
 
 
294 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0272184  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1364  co-chaperone protein DnaJ  40 
 
 
297 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1243  co-chaperone protein DnaJ  40 
 
 
297 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000103422  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00181  DnaJ-related protein  34.15 
 
 
227 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1195  heat shock protein DnaJ domain protein  44.9 
 
 
248 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01371  putative heat shock protein DnaJ  39.13 
 
 
232 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.333222 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3568  heat shock protein DnaJ domain protein  36.67 
 
 
335 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_42151  predicted protein  36.07 
 
 
402 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  37.5 
 
 
319 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0778  co-chaperone-curved DNA binding protein A  38.18 
 
 
288 aa  42.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1489  putative heat shock protein DnaJ  41.3 
 
 
216 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0397  heat shock protein DnaJ-like  34.48 
 
 
250 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1473  heat shock protein DnaJ-like  36.67 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.421811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.5 
 
 
319 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1036  hypothetical protein  37.5 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1619  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.38 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0976  co-chaperone protein DnaJ  38.18 
 
 
295 aa  42.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.984114  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  35.71 
 
 
309 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.5 
 
 
317 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5081  heat shock protein DnaJ domain protein  44.9 
 
 
196 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.181728  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_19643  predicted protein  37.78 
 
 
423 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0479063  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0805  protein translation intiation inhibitor  38.18 
 
 
296 aa  41.2  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000779647  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0018  DnaJ domain protein  32.56 
 
 
292 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.29 
 
 
318 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  34.55 
 
 
316 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0345  heat shock protein DnaJ domain protein  33.96 
 
 
258 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00881466 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45043  predicted protein  48.48 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251497  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  46.3 
 
 
258 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38616  predicted protein  40 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.126504  normal  0.22468 
 
 
-
 
NC_006686  CND04620  co-chaperone, putative  44.44 
 
 
522 aa  40.8  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1065  DnaJ domain-containing protein  36.36 
 
 
298 aa  40.8  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01941  putative heat shock protein DnaJ  39.13 
 
 
217 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0900  putative chaperone protein DnaJ  40 
 
 
383 aa  40.4  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3554  chaperone protein DnaJ  35.38 
 
 
388 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.562407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>