20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1036 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1036  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  226  9e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1473  heat shock protein DnaJ-like  76.06 
 
 
71 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.421811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2326  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.71 
 
 
178 aa  50.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04310  chaperone regulator, putative  51.52 
 
 
404 aa  44.7  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00566214  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38015  predicted protein  38.89 
 
 
398 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.964635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6714  putative heat shock protein DnaJ-like protein  41.82 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.146844 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  45.65 
 
 
258 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_42151  predicted protein  34.43 
 
 
402 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2790  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.5 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl299  heat shock protein chaperone  37.5 
 
 
218 aa  42.4  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  6.65204e-51  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2306  heat shock protein DnaJ-like  44.74 
 
 
195 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.452608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2284  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.67 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  50 
 
 
201 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1370  heat shock protein DnaJ-like  35.53 
 
 
231 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3329  heat shock protein DnaJ-like  45.28 
 
 
245 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0125  putative heat shock protein DnaJ  45.95 
 
 
225 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_19643  predicted protein  45.95 
 
 
423 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0479063  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1502  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.29 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.409821  normal  0.666997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3317  heat shock protein DnaJ-like  42.11 
 
 
98 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0326  heat shock protein DnaJ-like  43.18 
 
 
222 aa  40  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>