58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3329 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_3329  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 
245 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3059  heat shock protein DnaJ-like  80.99 
 
 
242 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2421  heat shock protein DnaJ-like  72.24 
 
 
261 aa  355  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4778  hypothetical protein  75.31 
 
 
238 aa  348  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2392  heat shock protein DnaJ-like  74.17 
 
 
244 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3560  heat shock protein DnaJ domain protein  76.86 
 
 
242 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665124  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1700  heat shock protein DnaJ  66.39 
 
 
298 aa  277  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.20246  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4540  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.75 
 
 
242 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0499659  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0353  heat shock protein DnaJ domain protein  52.47 
 
 
241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2256  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  58.28 
 
 
240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.404984  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0751  heat shock protein DnaJ domain protein  44.22 
 
 
243 aa  156  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000868694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1671  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.39 
 
 
250 aa  149  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.984207  normal  0.27085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1370  heat shock protein DnaJ-like  51.83 
 
 
231 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5342  heat shock protein DnaJ domain protein  41.59 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5266  heat shock protein DnaJ domain protein  45.56 
 
 
231 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2499  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.2 
 
 
253 aa  122  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86775  normal  0.0662441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2148  heat shock protein DnaJ-like  44.59 
 
 
252 aa  121  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0791  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48 
 
 
253 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.267414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4799  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.38 
 
 
231 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.111411 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1396  DnaJ domain-containing protein  47.65 
 
 
222 aa  115  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1860  aconitate hydratase 2  30.05 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3491  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.91 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1074  DnaJ domain-containing protein  52.73 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0316124  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3891  heat shock protein DnaJ domain protein  28.51 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.717519 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0818  DnaJ domain-containing protein  46.15 
 
 
128 aa  68.2  0.0000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0201  dnaJ domain-containing protein  46.77 
 
 
79 aa  63.9  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.138312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2790  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  57.41 
 
 
130 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0801  heat shock protein DnaJ, N-terminal  43.84 
 
 
140 aa  62.8  0.000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1072  DnaJ domain-containing protein  47.27 
 
 
56 aa  59.7  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0676389  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38616  predicted protein  50 
 
 
111 aa  56.2  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.126504  normal  0.22468 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45043  predicted protein  49.12 
 
 
153 aa  54.7  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251497  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0976  heat shock protein DnaJ-like  52 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.156674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3147  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.16 
 
 
141 aa  52.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.144632 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02230  chaperone, putative  48.15 
 
 
97 aa  50.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0113448  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1195  heat shock protein DnaJ domain protein  45.1 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1489  putative heat shock protein DnaJ  39.29 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_8096  predicted protein  47.17 
 
 
67 aa  49.3  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3317  heat shock protein DnaJ-like  35.56 
 
 
98 aa  49.3  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  35.24 
 
 
258 aa  48.9  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01941  putative heat shock protein DnaJ  37.5 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  54.72 
 
 
292 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2736  heat shock protein DnaJ-like  61.29 
 
 
201 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.58 
 
 
260 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0826  heat shock protein DnaJ domain protein  47.5 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000315568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0335  heat shock protein DnaJ-like protein  39.66 
 
 
153 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  43.14 
 
 
201 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1017  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.33 
 
 
116 aa  43.5  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01371  putative heat shock protein DnaJ  44.68 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.333222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6456  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.68 
 
 
325 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00677011 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1089  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.33 
 
 
116 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3732  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.51 
 
 
423 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.143539  normal  0.0525791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2507  heat shock protein DnaJ-like  44 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00174132  normal  0.410211 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_19643  predicted protein  40.38 
 
 
423 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0479063  normal  0.479816 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04559  Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim14 (Presequence translocated-associated motor subunit pam18) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4H1]  41.82 
 
 
105 aa  42.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0868  Dna-J like membrane chaperone protein  28.12 
 
 
259 aa  42.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04199  DnaJ domain protein  38.46 
 
 
109 aa  42.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  41.07 
 
 
309 aa  42  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06170  DnaJ domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08300)  52.94 
 
 
418 aa  42  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.281227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>