75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2392 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2392  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 
244 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3059  heat shock protein DnaJ-like  86.67 
 
 
242 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3329  heat shock protein DnaJ-like  74.17 
 
 
245 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3560  heat shock protein DnaJ domain protein  82.08 
 
 
242 aa  352  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665124  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4778  hypothetical protein  71.97 
 
 
238 aa  333  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2421  heat shock protein DnaJ-like  69.46 
 
 
261 aa  330  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1700  heat shock protein DnaJ  67.22 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.20246  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0353  heat shock protein DnaJ domain protein  54.05 
 
 
241 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4540  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.13 
 
 
242 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0499659  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2256  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.97 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.404984  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1671  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.13 
 
 
250 aa  155  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.984207  normal  0.27085 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0751  heat shock protein DnaJ domain protein  41.22 
 
 
243 aa  153  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000868694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5342  heat shock protein DnaJ domain protein  43.6 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1370  heat shock protein DnaJ-like  50 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2499  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.65 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86775  normal  0.0662441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4799  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.71 
 
 
231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.111411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5266  heat shock protein DnaJ domain protein  45.71 
 
 
231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2148  heat shock protein DnaJ-like  44.91 
 
 
252 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1396  DnaJ domain-containing protein  46.91 
 
 
222 aa  112  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0791  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.75 
 
 
253 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.267414 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1860  aconitate hydratase 2  29.8 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3491  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0801  heat shock protein DnaJ, N-terminal  44.93 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1074  DnaJ domain-containing protein  49.15 
 
 
102 aa  70.9  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0316124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2790  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  59.26 
 
 
130 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0201  dnaJ domain-containing protein  47.06 
 
 
79 aa  64.7  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.138312  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0818  DnaJ domain-containing protein  41.89 
 
 
128 aa  63.5  0.000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3891  heat shock protein DnaJ domain protein  30.4 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.717519 
 
 
-
 
NC_002978  WD1072  DnaJ domain-containing protein  45.45 
 
 
56 aa  58.2  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0676389  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0976  heat shock protein DnaJ-like  50 
 
 
256 aa  53.1  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.156674  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45043  predicted protein  47.46 
 
 
153 aa  52.8  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251497  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_8096  predicted protein  49.06 
 
 
67 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38616  predicted protein  46.43 
 
 
111 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.126504  normal  0.22468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3147  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.21 
 
 
141 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.144632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1195  heat shock protein DnaJ domain protein  45.1 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02230  chaperone, putative  45.45 
 
 
97 aa  49.3  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0113448  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4007  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.14 
 
 
253 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1489  putative heat shock protein DnaJ  35.09 
 
 
216 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3317  heat shock protein DnaJ-like  38.33 
 
 
98 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01941  putative heat shock protein DnaJ  33.33 
 
 
217 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  0.790247 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04559  Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim14 (Presequence translocated-associated motor subunit pam18) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4H1]  40.28 
 
 
105 aa  45.8  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5081  heat shock protein DnaJ domain protein  44.9 
 
 
196 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.181728  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  52.83 
 
 
292 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3073  Dna-J like membrane chaperone protein  41.46 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70305  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  46.94 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5925  heat shock protein DnaJ domain protein  50 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0335  heat shock protein DnaJ-like protein  39.66 
 
 
153 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4446  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4335  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7152000000000002e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4394  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000485596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4212  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000364555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4050  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.16235e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2736  heat shock protein DnaJ-like  48.72 
 
 
201 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4538  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000345209  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1089  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.33 
 
 
116 aa  43.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1718  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.97 
 
 
153 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.82766  normal  0.111433 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1017  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.33 
 
 
116 aa  43.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0307  hypothetical protein  45.71 
 
 
361 aa  43.1  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  48.65 
 
 
297 aa  42.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_42151  predicted protein  37.74 
 
 
402 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4432  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000040586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6456  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.68 
 
 
325 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00677011 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0804  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000435348  decreased coverage  1.53546e-22 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4476  heat shock protein DnaJ domain protein  44.9 
 
 
240 aa  42.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00486876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3374  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.34 
 
 
347 aa  42.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4164  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 
368 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000033123  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0020  Dna-J like membrane chaperone protein  36.07 
 
 
276 aa  42.7  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  48.65 
 
 
297 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  41.07 
 
 
309 aa  42.7  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06170  DnaJ domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08300)  55.88 
 
 
418 aa  42.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.281227 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00670  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  39.62 
 
 
321 aa  42.4  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.772796  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.94 
 
 
268 aa  42  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2781  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4917  heat shock protein DnaJ, N-terminal  37.29 
 
 
341 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34896  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1465  heat shock protein DnaJ domain protein  38.89 
 
 
213 aa  42  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00965011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>