251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4007 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4007  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 		 253 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5129  heat shock protein DnaJ-like  62.89 
 
 		 255 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.583171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0557  DnaJ-like protein DjlA, putative  58.82 
 
 		 255 aa  294  9e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4621  heat shock protein DnaJ, N-terminal  58.82 
 
 		 255 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.628986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0438  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  59.61 
 
 		 255 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  58.43 
 
 		 255 aa  289  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0407  heat shock protein DnaJ domain protein  58.43 
 
 		 255 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  60 
 
 		 254 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07800  hypothetical protein  59.45 
 
 		 252 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0234725 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0742  hypothetical protein  59.45 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46770  heat shock protein DnaJ-like protein  55.86 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2075  Dna-J like membrane chaperone protein  30.26 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000570933  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0104  Dna-J like membrane chaperone protein  30.26 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000467525  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.83 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0892  Dna-J like membrane chaperone protein  30.71 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1055  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.32 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00001887  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0100  heat shock protein DnaJ-like protein  31.09 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0372  Dna-J like membrane chaperone protein  31.36 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  30.3 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3415  Dna-J like membrane chaperone protein  25.96 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258634  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3109  Dna-J like membrane chaperone protein  30.3 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  31.41 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000026636  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03410  Dna-J like membrane chaperone protein  30.82 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4522  Dna-J like membrane chaperone protein  30.07 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0061  Dna-J like membrane chaperone protein  31.54 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000204638  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3440  Dna-J like membrane chaperone protein  28.78 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000544251  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  29.92 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3544  heat shock protein DnaJ domain protein  31.05 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.15628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0104  Dna-J like membrane chaperone protein  31.23 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141328  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0061  Dna-J like membrane chaperone protein  31.05 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000128159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3600  Dna-J like membrane chaperone protein  31.05 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000271898  hitchhiker  0.00000323028 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0100  Dna-J like membrane chaperone protein  31.23 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000327368  normal  0.0501049 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0099  Dna-J like membrane chaperone protein  31.23 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0106  Dna-J like membrane chaperone protein  31.23 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000540131  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  30.74 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000613097  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0101  Dna-J like membrane chaperone protein  31.23 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000130204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0983  Dna-J like membrane chaperone protein  31.17 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.193447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1052  Dna-J like membrane chaperone protein  31.17 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0982922  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1907  Dna-J like membrane chaperone protein  27.47 
 
 		 271 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0768  Dna-J like membrane chaperone protein  28.62 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128794  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0885  Dna-J like membrane chaperone protein  29.81 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00720639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3569  Dna-J like membrane chaperone protein  28.62 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000771944  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  29.55 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00059  Dna-J like membrane chaperone protein  30.69 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00058  hypothetical protein  30.69 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000167853  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0049  Dna-J like membrane chaperone protein  30.32 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000477601  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1291  Dna-J like membrane chaperone protein  31.34 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2813  Dna-J like membrane chaperone protein  29.32 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603068  normal  0.639961 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1020  Dna-J like membrane chaperone protein  28.24 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.325317  normal  0.0319615 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1051  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.15 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3306  Dna-J like membrane chaperone protein  30.77 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0020  Dna-J like membrane chaperone protein  33.18 
 
 		 276 aa  99.4  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0995  Dna-J like membrane chaperone protein  28.24 
 
 		 262 aa  99  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2865  Dna-J like membrane chaperone protein  29.77 
 
 		 284 aa  99  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787957  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0970  Dna-J like membrane chaperone protein  29.06 
 
 		 259 aa  98.6  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0207673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0868  Dna-J like membrane chaperone protein  29.5 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2882  Dna-J like membrane chaperone protein  27.97 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450671  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0604  Dna-J like membrane chaperone protein  29.54 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000356276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0728  Dna-J like membrane chaperone protein  29.07 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000304706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001661  DnaJ-like protein DjlA  30.59 
 
 		 284 aa  96.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.72 
 
 		 268 aa  96.3  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2781  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2262  Dna-J like membrane chaperone protein  28.22 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1747  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.31 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000151297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3633  Dna-J like membrane chaperone protein  28.19 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2289  Dna-J like membrane chaperone protein  26.83 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3631  Dna-J like membrane chaperone protein  28.32 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.181642  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0397  heat shock protein DnaJ-like  25.96 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3828  Dna-J like membrane chaperone protein  28.28 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00812  Dna-J like membrane chaperone protein  27.6 
 
 		 286 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3073  Dna-J like membrane chaperone protein  26.67 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0567  Dna-J like membrane chaperone protein  26.09 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2989  Dna-J like membrane chaperone protein  32.04 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0668  DnaJ domain-containing protein  24.79 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.165012  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  24.1 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3513  Fis family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0606  Dna-J like membrane chaperone protein  26.25 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0546  DnaJ-like protein  22.68 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2252  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.48 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0977  DnaJ domain-containing protein  25.13 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0827  DnaJ domain-containing protein  25.13 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2884  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.45 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842041  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1034  DnaJ domain-containing protein  24.1 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0627693  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2408  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  23.97 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.553614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03720  DnaJ domain containing protein  23.11 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.338466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1897  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.29 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.394264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0207  DnaJ domain-containing protein  22.06 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1837  DnaJ domain-containing protein  23.04 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0557  DnaJ domain-containing protein  22.17 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223519  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1860  heat shock protein DnaJ-like  24.04 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0961  hypothetical protein  24.11 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.483965  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  23.17 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0233536  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2092  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.73 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.764372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0905  protein of unknown function DUF1332  23.17 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0299728  normal  0.285713 
 
 
-
 
NC_004310  BR1445  DnaJ domain-containing protein  23.44 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0302292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2298  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.8 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622432  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0826  heat shock protein DnaJ domain protein  25.78 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000315568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2006  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  23.14 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0210769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0217  heat shock protein DnaJ domain protein  43.33 
 
 		 412 aa  52.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0880  heat shock protein DnaJ domain protein  22.39 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0258  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.15 
 
 		 451 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>