90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3560 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3560  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 		 242 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3329  heat shock protein DnaJ-like  76.86 
 
 		 245 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2392  heat shock protein DnaJ-like  82.08 
 
 		 244 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3059  heat shock protein DnaJ-like  85.12 
 
 		 242 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2421  heat shock protein DnaJ-like  71.49 
 
 		 261 aa  341  7e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4778  hypothetical protein  73.11 
 
 		 238 aa  331  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1700  heat shock protein DnaJ  66.67 
 
 		 298 aa  272  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.20246  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4540  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.96 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0499659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0353  heat shock protein DnaJ domain protein  52.7 
 
 		 241 aa  164  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2256  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  58.78 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.404984  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0751  heat shock protein DnaJ domain protein  42.57 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000868694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1671  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.97 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.984207  normal  0.27085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1370  heat shock protein DnaJ-like  51.63 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5342  heat shock protein DnaJ domain protein  40.28 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0791  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.04 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.267414 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2148  heat shock protein DnaJ-like  43.11 
 
 		 252 aa  125  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2499  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.8 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86775  normal  0.0662441 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5266  heat shock protein DnaJ domain protein  47.33 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4799  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.33 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.111411 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1396  DnaJ domain-containing protein  46.98 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1860  aconitate hydratase 2  29.67 
 
 		 235 aa  95.1  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3491  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.03 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0801  heat shock protein DnaJ, N-terminal  44.93 
 
 		 140 aa  73.9  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1074  DnaJ domain-containing protein  50.85 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0316124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2790  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  59.26 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0201  dnaJ domain-containing protein  47.06 
 
 		 79 aa  65.1  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.138312  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0818  DnaJ domain-containing protein  45.76 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1072  DnaJ domain-containing protein  47.27 
 
 		 56 aa  60.1  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0676389  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3891  heat shock protein DnaJ domain protein  49.09 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.717519 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0976  heat shock protein DnaJ-like  52 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.156674  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_8096  predicted protein  49.06 
 
 		 67 aa  53.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1195  heat shock protein DnaJ domain protein  49.02 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38616  predicted protein  46.43 
 
 		 111 aa  52  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.126504  normal  0.22468 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45043  predicted protein  45.76 
 
 		 153 aa  52  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1489  putative heat shock protein DnaJ  36.84 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3147  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.16 
 
 		 141 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.144632 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02230  chaperone, putative  45.45 
 
 		 97 aa  49.7  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0113448  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3317  heat shock protein DnaJ-like  41.67 
 
 		 98 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.58 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01941  putative heat shock protein DnaJ  35.09 
 
 		 217 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0307  hypothetical protein  51.43 
 
 		 361 aa  45.4  0.0008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  35.71 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  43.75 
 
 		 326 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4538  chaperone protein DnaJ  54.29 
 
 		 371 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000345209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4335  chaperone protein DnaJ  54.29 
 
 		 371 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7152000000000002e-45 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6456  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.81 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00677011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0020  Dna-J like membrane chaperone protein  40.32 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  54.72 
 
 		 292 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  54.29 
 
 		 371 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4394  chaperone protein DnaJ  54.29 
 
 		 371 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000485596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4212  chaperone protein DnaJ  54.29 
 
 		 371 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000364555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4050  chaperone protein DnaJ  54.29 
 
 		 371 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.16235e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0335  heat shock protein DnaJ-like protein  41.38 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4446  chaperone protein DnaJ  54.29 
 
 		 371 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0804  chaperone protein DnaJ  54.29 
 
 		 371 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000435348  decreased coverage  1.53546e-22 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04559  Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim14 (Presequence translocated-associated motor subunit pam18) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4H1]  37.18 
 
 		 105 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_42151  predicted protein  38.33 
 
 		 402 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4432  chaperone protein DnaJ  54.29 
 
 		 371 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000040586  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1017  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  56.67 
 
 		 116 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5925  heat shock protein DnaJ domain protein  50 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3554  chaperone protein DnaJ  35.94 
 
 		 388 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.562407  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 		 387 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 		 387 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  42.86 
 
 		 309 aa  43.9  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4164  chaperone protein DnaJ  54.29 
 
 		 368 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000033123  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 		 382 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1089  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  56.67 
 
 		 116 aa  44.3  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0536  heat shock protein DnaJ domain protein  41.38 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00670  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  41.51 
 
 		 321 aa  43.5  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.772796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2736  heat shock protein DnaJ-like  48.72 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  48.65 
 
 		 297 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1465  heat shock protein DnaJ domain protein  40.74 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00965011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4917  heat shock protein DnaJ, N-terminal  37.29 
 
 		 341 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.43 
 
 		 315 aa  43.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  48.65 
 
 		 297 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0444  DnaJ-class molecular chaperone  43.14 
 
 		 381 aa  43.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.771058  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89287  predicted protein  45.65 
 
 		 346 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0180509 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06170  DnaJ domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08300)  55.88 
 
 		 418 aa  42.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.281227 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5081  heat shock protein DnaJ domain protein  42.86 
 
 		 196 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.181728  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4476  heat shock protein DnaJ domain protein  50 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00486876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5363  DnaJ domain protein  38.89 
 
 		 337 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0527  chaperone protein DnaJ  44.19 
 
 		 364 aa  42.4  0.007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1310  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.07 
 
 		 143 aa  42  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107849  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0900  putative chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 		 383 aa  42  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0557  DnaJ domain-containing protein  37.21 
 
 		 246 aa  42  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223519  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  48.57 
 
 		 373 aa  42  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04199  DnaJ domain protein  38.46 
 
 		 109 aa  42  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01371  putative heat shock protein DnaJ  42.55 
 
 		 232 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.333222 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0885  Dna-J like membrane chaperone protein  28.38 
 
 		 258 aa  42  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00720639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  41.18 
 
 		 201 aa  42  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>