87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5266 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_5266  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 
231 aa  447  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4799  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  97.72 
 
 
231 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.111411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5342  heat shock protein DnaJ domain protein  84.47 
 
 
231 aa  360  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0791  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.33 
 
 
253 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.267414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2256  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  59.86 
 
 
240 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.404984  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0353  heat shock protein DnaJ domain protein  52.88 
 
 
241 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2392  heat shock protein DnaJ-like  41.23 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3059  heat shock protein DnaJ-like  48.05 
 
 
242 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3329  heat shock protein DnaJ-like  41.43 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2421  heat shock protein DnaJ-like  40.76 
 
 
261 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0751  heat shock protein DnaJ domain protein  46.58 
 
 
243 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000868694 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3560  heat shock protein DnaJ domain protein  47.33 
 
 
242 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665124  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1671  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.9 
 
 
250 aa  122  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.984207  normal  0.27085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1370  heat shock protein DnaJ-like  47.59 
 
 
231 aa  121  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4540  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.01 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0499659  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4778  hypothetical protein  38.94 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1700  heat shock protein DnaJ  48 
 
 
298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.20246  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2499  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.35 
 
 
253 aa  95.1  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86775  normal  0.0662441 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1396  DnaJ domain-containing protein  44.9 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2148  heat shock protein DnaJ-like  34.84 
 
 
252 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1860  aconitate hydratase 2  33.33 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2790  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  55.93 
 
 
130 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0201  dnaJ domain-containing protein  41.1 
 
 
79 aa  60.5  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.138312  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0801  heat shock protein DnaJ, N-terminal  40.28 
 
 
140 aa  60.8  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3491  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50 
 
 
168 aa  60.1  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1074  DnaJ domain-containing protein  43.86 
 
 
102 aa  58.2  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0316124  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1072  DnaJ domain-containing protein  46.43 
 
 
56 aa  56.6  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0676389  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0976  heat shock protein DnaJ-like  50.94 
 
 
256 aa  55.1  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.156674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3147  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.54 
 
 
141 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.144632 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3317  heat shock protein DnaJ-like  50.91 
 
 
98 aa  52  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  52 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0818  DnaJ domain-containing protein  38.6 
 
 
128 aa  50.4  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3891  heat shock protein DnaJ domain protein  42.86 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.717519 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2225  heat shock protein DnaJ domain protein  42.65 
 
 
182 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.316967  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01371  putative heat shock protein DnaJ  39.53 
 
 
232 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.333222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6456  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  55.81 
 
 
325 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00677011 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1195  heat shock protein DnaJ domain protein  49.02 
 
 
248 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1905  hypothetical protein  44 
 
 
185 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2883  heat shock protein DnaJ domain protein  33.33 
 
 
202 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.936925 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  45.83 
 
 
741 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26301  putative heat shock protein DnaJ  51.16 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1489  putative heat shock protein DnaJ  36.36 
 
 
216 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0730  heat shock protein DnaJ domain protein  39.06 
 
 
276 aa  45.1  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45043  predicted protein  44.83 
 
 
153 aa  45.1  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251497  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0207  DnaJ domain-containing protein  22.94 
 
 
273 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06170  DnaJ domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08300)  50 
 
 
418 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.281227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6481  heat shock protein DnaJ domain protein  44.9 
 
 
383 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  51.43 
 
 
373 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01941  putative heat shock protein DnaJ  34.55 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0370  chaperone protein DnaJ  32.79 
 
 
372 aa  44.3  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.980316  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.79 
 
 
339 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  37.93 
 
 
356 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3451  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.94 
 
 
169 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.658734  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  34.43 
 
 
388 aa  43.9  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  36.84 
 
 
356 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  37.7 
 
 
385 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 
359 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3554  chaperone protein DnaJ  43.24 
 
 
388 aa  43.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.562407  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0231  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.71 
 
 
393 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208592  normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  42.86 
 
 
307 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38616  predicted protein  39.29 
 
 
111 aa  42.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.126504  normal  0.22468 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0804  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
371 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000435348  decreased coverage  1.53546e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4432  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
371 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000040586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4394  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000485596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4212  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000364555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4050  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.16235e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4538  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000345209  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  36.36 
 
 
326 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4335  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
371 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7152000000000002e-45 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  38.64 
 
 
381 aa  42.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4446  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  47.22 
 
 
382 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0639  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.13 
 
 
331 aa  42.4  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0618  heat shock protein DnaJ domain protein  39.13 
 
 
331 aa  42.4  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  32.79 
 
 
383 aa  42.4  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0900  putative chaperone protein DnaJ  39.62 
 
 
383 aa  42.4  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0444  DnaJ-class molecular chaperone  39.62 
 
 
381 aa  42  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.771058  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_9940  predicted protein  42.86 
 
 
60 aa  42  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0433566 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04250  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  37.7 
 
 
282 aa  42  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.17 
 
 
319 aa  42  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_8096  predicted protein  37.04 
 
 
67 aa  42  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  38.3 
 
 
373 aa  42  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.38 
 
 
206 aa  41.6  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1805  heat shock protein DnaJ domain protein  36.51 
 
 
186 aa  41.6  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 
374 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 
374 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>