More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6481 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6481  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 
383 aa  756    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16800  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  51.75 
 
 
372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal  0.640022 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  56.92 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3732  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.143539  normal  0.0525791 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  44.55 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6927  heat shock protein DnaJ domain protein  56.67 
 
 
209 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.249011  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1000  heat shock protein DnaJ domain protein  48 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5932  heat shock protein DnaJ domain protein  55 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  50 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02638  curved DNA binding protein  43.88 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3177  heat shock protein DnaJ-like protein  59.02 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  51.56 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3070  chaperone DnaJ domain protein  46.48 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3451  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  59.02 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.658734  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00670  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  51.67 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.772796  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.3 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01361  putative heat shock protein DnaJ  34.44 
 
 
225 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.105788  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  35.64 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01391  putative heat shock protein DnaJ  48.28 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.629176  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  35.64 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  47.95 
 
 
370 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0125  putative heat shock protein DnaJ  50 
 
 
225 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  43.48 
 
 
326 aa  67  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  47.95 
 
 
370 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.04 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26301  putative heat shock protein DnaJ  54.69 
 
 
232 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.89 
 
 
313 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2735  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.28 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.879449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  48.53 
 
 
386 aa  67  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1619  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.67 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0444  DnaJ-class molecular chaperone  50.79 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.771058  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  52.38 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0096  chaperone DnaJ domain protein  45.16 
 
 
310 aa  65.9  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.274204 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0023  chaperone protein DnaJ  36.27 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1001  heat shock protein DnaJ domain protein  38.46 
 
 
172 aa  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1433  DnaJ protein  52.38 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3405  chaperone protein DnaJ  45.59 
 
 
375 aa  65.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01401  putative heat shock protein DnaJ  50 
 
 
235 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.634146  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.62 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2459  heat shock protein DnaJ domain protein  38.05 
 
 
314 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000295902 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1549  chaperone DnaJ domain protein  47.62 
 
 
372 aa  64.7  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1364  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.38 
 
 
293 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0451  chaperone protein DnaJ  45.83 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2436  heat shock protein DnaJ-like  50 
 
 
294 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2059  chaperone protein DnaJ  50.77 
 
 
376 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0647  chaperone DnaJ domain protein  50.7 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.77 
 
 
324 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  41.67 
 
 
310 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13440  chaperone protein DnaJ  47.62 
 
 
372 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1945  molecular chaperone DnaJ family  44.78 
 
 
203 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  46.48 
 
 
315 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2529  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
379 aa  64.3  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  41.67 
 
 
310 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  44.59 
 
 
388 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  40.24 
 
 
377 aa  64.3  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_8469  predicted protein  44.83 
 
 
61 aa  63.9  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3014  heat shock protein DnaJ domain protein  42.47 
 
 
458 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  46.03 
 
 
309 aa  63.9  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 
356 aa  63.9  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  41.89 
 
 
379 aa  63.5  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  41.98 
 
 
316 aa  63.5  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  46.03 
 
 
356 aa  63.5  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  45.59 
 
 
380 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  45.31 
 
 
340 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 
386 aa  63.5  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  33.01 
 
 
291 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17290  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  48.39 
 
 
375 aa  63.5  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.88 
 
 
287 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1645  chaperone protein DnaJ  49.23 
 
 
383 aa  63.5  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0266103  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 
382 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2303  chaperone protein DnaJ  48.44 
 
 
384 aa  63.5  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0682598  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4726  DnaJ central region:heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  49.3 
 
 
321 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
379 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  45.59 
 
 
380 aa  63.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  45.95 
 
 
330 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  45.59 
 
 
385 aa  63.2  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  47.83 
 
 
381 aa  63.2  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.21 
 
 
323 aa  63.2  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.88 
 
 
289 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
379 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4024  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.61 
 
 
316 aa  63.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.0763204 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  44.12 
 
 
374 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0942  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  37.5 
 
 
377 aa  63.2  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.122373  normal  0.06017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  45.95 
 
 
375 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 
388 aa  63.2  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5061  chaperone DnaJ domain protein  34.07 
 
 
303 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2427  heat shock protein DnaJ-like  45.07 
 
 
156 aa  63.2  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0087  chaperone protein DnaJ  46.15 
 
 
373 aa  63.2  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.60044  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  33.67 
 
 
309 aa  62.8  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11700  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  50 
 
 
376 aa  62.8  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482497  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 
383 aa  62.8  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  38.3 
 
 
341 aa  62.8  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1607  chaperone protein DnaJ  40.24 
 
 
355 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231275  normal  0.231372 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2209  chaperone DnaJ domain protein  45.45 
 
 
374 aa  62.8  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.990749  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07680  chaperone protein DnaJ  47.14 
 
 
373 aa  62.8  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.447562 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1003  heat shock protein DnaJ domain protein  29.17 
 
 
311 aa  62.8  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0005  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  47.06 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>