More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1001 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1001  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 
172 aa  342  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  68.75 
 
 
302 aa  93.2  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1000  heat shock protein DnaJ domain protein  57.75 
 
 
314 aa  90.9  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0535  chaperone protein DnaJ  64.06 
 
 
379 aa  88.2  5e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1244  chaperone protein DnaJ  63.64 
 
 
375 aa  87  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  63.08 
 
 
298 aa  86.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  63.08 
 
 
373 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  59.38 
 
 
381 aa  85.1  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0675  heat shock protein  47.37 
 
 
276 aa  84.7  5e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.745295  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  60 
 
 
359 aa  84.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.88 
 
 
334 aa  84  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  58.46 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2103  heat shock protein DnaJ domain protein  61.19 
 
 
220 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000586336  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  55.38 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  57.81 
 
 
404 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  59.38 
 
 
388 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  54.79 
 
 
379 aa  82.4  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1443  DNAJ class chaperone; heat shock protein  43.48 
 
 
402 aa  81.6  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  57.81 
 
 
302 aa  81.6  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  59.38 
 
 
386 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  46.84 
 
 
385 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  53.85 
 
 
316 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  53.85 
 
 
375 aa  80.5  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  53.03 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1776  chaperone protein DnaJ  56.25 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0739  chaperone protein DnaJ  56.92 
 
 
355 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0087  chaperone protein DnaJ  61.54 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.60044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3014  heat shock protein DnaJ domain protein  51.47 
 
 
458 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  53.12 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  58.46 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0351  chaperone DnaJ domain protein  56.25 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.697421 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  52.7 
 
 
374 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  52.31 
 
 
372 aa  79  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  53.12 
 
 
382 aa  79  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
379 aa  79  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
379 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  51.56 
 
 
385 aa  79  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  54.55 
 
 
395 aa  78.6  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
389 aa  78.6  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  60.94 
 
 
385 aa  78.6  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2614  heat shock protein DnaJ domain protein  41.9 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  57.97 
 
 
291 aa  78.6  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  57.14 
 
 
294 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  56.25 
 
 
382 aa  78.2  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  53.12 
 
 
297 aa  78.2  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
380 aa  78.2  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  56.25 
 
 
297 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  56.25 
 
 
297 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  56.25 
 
 
387 aa  78.2  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  50.68 
 
 
380 aa  77.8  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  38.52 
 
 
307 aa  77.8  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  56.25 
 
 
386 aa  77.8  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  56.25 
 
 
384 aa  77.8  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  56.25 
 
 
376 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  57.81 
 
 
393 aa  77  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  56.06 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01135  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
381 aa  77  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4435  chaperone DnaJ domain protein  56.06 
 
 
311 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  55.38 
 
 
311 aa  77  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  55.56 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  56.25 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  51.9 
 
 
396 aa  77  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0034  chaperone protein DnaJ  56.25 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  51.56 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  56.25 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0663  chaperone DnaJ domain protein  53.12 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3209  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
385 aa  76.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492328  normal  0.368243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  54.69 
 
 
376 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  54.69 
 
 
376 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  51.56 
 
 
356 aa  75.5  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2086  DnaJ domain-containing protein  52.31 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000110327  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2577  chaperone protein DnaJ  54.55 
 
 
385 aa  75.5  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00027839 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3820  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
378 aa  75.5  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
379 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
379 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5216  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
404 aa  75.5  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
379 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1003  heat shock protein DnaJ domain protein  56.25 
 
 
311 aa  75.5  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
379 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  47.3 
 
 
381 aa  75.5  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  56.25 
 
 
376 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  54.69 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  59.38 
 
 
382 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
379 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  54.55 
 
 
376 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
370 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  53.85 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
376 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
376 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
376 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
370 aa  75.5  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
376 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
376 aa  75.5  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  51.56 
 
 
374 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  51.56 
 
 
385 aa  75.1  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0097  chaperone protein DnaJ  46.84 
 
 
361 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00841674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  54.69 
 
 
376 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  51.56 
 
 
374 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>