More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3405 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3405  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
375 aa  752    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13440  chaperone protein DnaJ  62.86 
 
 
372 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2209  chaperone DnaJ domain protein  62.77 
 
 
374 aa  450  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.990749  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2235  chaperone protein DnaJ  59.68 
 
 
375 aa  435  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0177525  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2191  chaperone DnaJ domain protein  62.27 
 
 
374 aa  426  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1972  chaperone protein DnaJ  59.15 
 
 
375 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000781589 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3252  chaperone protein DnaJ  57.45 
 
 
376 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199351  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1549  chaperone DnaJ domain protein  60.37 
 
 
372 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7057  chaperone protein DnaJ  60.26 
 
 
378 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409815  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0839  heat shock protein DnaJ  56.99 
 
 
379 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0215483  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1749  chaperone DnaJ domain protein  59.26 
 
 
375 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.378559  normal  0.79074 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1151  chaperone protein DnaJ  60.58 
 
 
376 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2290  chaperone DnaJ  58.2 
 
 
380 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0702  chaperone protein DnaJ  54.76 
 
 
379 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12360  chaperone protein DnaJ  56.76 
 
 
377 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0467451  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0784  chaperone protein DnaJ  55.91 
 
 
377 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0590762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2110  chaperone protein DnaJ  56.91 
 
 
380 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17290  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  55.65 
 
 
375 aa  363  2e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3455  chaperone protein DnaJ  54.33 
 
 
381 aa  362  4e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3835  chaperone protein DnaJ  53.66 
 
 
382 aa  361  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.504584  hitchhiker  0.000855612 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1265  chaperone DnaJ  56.58 
 
 
379 aa  359  5e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0905779 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11700  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  55.38 
 
 
376 aa  355  5e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482497  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1644  chaperone protein DnaJ  57.1 
 
 
374 aa  352  8e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1572  chaperone DnaJ domain protein  55.5 
 
 
386 aa  351  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.0160005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13550  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  54.45 
 
 
385 aa  341  9e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.685498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5455  chaperone protein DnaJ  53.65 
 
 
389 aa  339  4e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3836  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
383 aa  339  4e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.575279  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3459  chaperone protein DnaJ  50.65 
 
 
384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3522  chaperone protein DnaJ  50.65 
 
 
384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.495865  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3470  chaperone protein DnaJ  50.65 
 
 
384 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12398  chaperone protein DnaJ  50.92 
 
 
382 aa  333  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000162557  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1242  chaperone DnaJ domain protein  52.91 
 
 
384 aa  332  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0347494  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2702  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
381 aa  332  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1904  chaperone protein DnaJ  54.64 
 
 
391 aa  322  5e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0900  putative chaperone protein DnaJ  41.97 
 
 
383 aa  306  3e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  42.33 
 
 
376 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3162  chaperone DnaJ domain protein  49.48 
 
 
387 aa  298  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.354519  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  42.15 
 
 
386 aa  296  5e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  41.69 
 
 
375 aa  294  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  44.83 
 
 
374 aa  292  6e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0164  chaperone protein DnaJ  42.48 
 
 
377 aa  290  2e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  44.41 
 
 
373 aa  290  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  43.12 
 
 
382 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  42.64 
 
 
382 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  40.68 
 
 
374 aa  289  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  42.38 
 
 
382 aa  288  9e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  39.14 
 
 
388 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  42.22 
 
 
373 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  41.33 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  43.01 
 
 
377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  44.88 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2765  chaperone protein DnaJ  48.19 
 
 
389 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  42.77 
 
 
370 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  39.79 
 
 
380 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  42.93 
 
 
372 aa  279  5e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  43.92 
 
 
376 aa  279  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  43.42 
 
 
378 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  43.42 
 
 
378 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  43.68 
 
 
378 aa  279  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  41.09 
 
 
374 aa  279  7e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  42.09 
 
 
386 aa  278  7e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  43.68 
 
 
378 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  43.68 
 
 
378 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  43.68 
 
 
378 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  42.13 
 
 
374 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  40.05 
 
 
381 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  44.18 
 
 
376 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  41.99 
 
 
379 aa  277  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  42.74 
 
 
377 aa  276  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  41.04 
 
 
382 aa  275  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  42.89 
 
 
378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  43.39 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  42.77 
 
 
370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  43.39 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  43.39 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0127  chaperone DnaJ  41.78 
 
 
378 aa  273  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  41.87 
 
 
374 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0444  DnaJ-class molecular chaperone  41.45 
 
 
381 aa  273  5.000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.771058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  43.12 
 
 
376 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  43.12 
 
 
376 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  43.12 
 
 
376 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  43.12 
 
 
376 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2074  chaperone protein DnaJ  42.09 
 
 
376 aa  269  7e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  43.45 
 
 
380 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3209  chaperone protein DnaJ  39.64 
 
 
385 aa  268  8.999999999999999e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492328  normal  0.368243 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  41.09 
 
 
356 aa  268  1e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  43.47 
 
 
373 aa  268  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  43.6 
 
 
375 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  41.8 
 
 
375 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0098  chaperone protein DnaJ  40.11 
 
 
379 aa  267  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0620001  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  43.18 
 
 
381 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  41.6 
 
 
374 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
379 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
379 aa  266  4e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  39.89 
 
 
375 aa  266  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0379  chaperone protein DnaJ  41.55 
 
 
376 aa  265  7e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  43.1 
 
 
384 aa  265  7e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  40.16 
 
 
384 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  44.07 
 
 
379 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>