More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1619 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1619  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
205 aa  411  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1945  molecular chaperone DnaJ family  74.87 
 
 
203 aa  304  7e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6927  heat shock protein DnaJ domain protein  56.04 
 
 
209 aa  207  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.249011  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5932  heat shock protein DnaJ domain protein  55.14 
 
 
209 aa  204  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16800  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  50.72 
 
 
372 aa  68.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal  0.640022 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5385  predicted protein  47.76 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.117735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6481  heat shock protein DnaJ domain protein  47.76 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2364  heat shock protein DnaJ-like  48 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.719019  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04620  co-chaperone, putative  50 
 
 
522 aa  66.2  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2459  heat shock protein DnaJ domain protein  52.63 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000295902 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01361  putative heat shock protein DnaJ  44.07 
 
 
225 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.105788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3451  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  54.39 
 
 
169 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.658734  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_9940  predicted protein  48.33 
 
 
60 aa  63.2  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0433566 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  43.66 
 
 
377 aa  62.8  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0125  putative heat shock protein DnaJ  43.86 
 
 
225 aa  61.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3177  heat shock protein DnaJ-like protein  51.61 
 
 
261 aa  61.6  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_19643  predicted protein  43.55 
 
 
423 aa  60.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0479063  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3732  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  54.24 
 
 
423 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.143539  normal  0.0525791 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01391  putative heat shock protein DnaJ  40.35 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.629176  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0511  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.65 
 
 
352 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.389255  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  43.28 
 
 
336 aa  60.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01371  putative heat shock protein DnaJ  37.33 
 
 
232 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.333222 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15898  predicted protein  43.94 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01135  chaperone protein DnaJ  46.27 
 
 
381 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  46.27 
 
 
382 aa  60.1  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0087  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
373 aa  59.7  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.60044  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0078  chaperone protein DnaJ  37.36 
 
 
369 aa  58.9  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000211475  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04310  chaperone regulator, putative  45 
 
 
404 aa  58.9  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00566214  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0078  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 
369 aa  58.5  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0264458  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12360  chaperone protein DnaJ  46.27 
 
 
377 aa  58.5  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0467451  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_8469  predicted protein  43.33 
 
 
61 aa  58.2  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182467  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0451  chaperone protein DnaJ  43.48 
 
 
375 aa  58.2  0.00000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0511  chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 
378 aa  58.2  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.100964  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1023  molecular chaperone DnaJ family  41.27 
 
 
429 aa  58.2  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3636  heat shock protein DnaJ, N-terminal  45.21 
 
 
92 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00302094  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  46.15 
 
 
310 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  46.15 
 
 
310 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0784  chaperone protein DnaJ  45.59 
 
 
377 aa  57.4  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0590762 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  39.71 
 
 
381 aa  57.4  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03463  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G05400)  41.77 
 
 
519 aa  57  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000000000832444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1309  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.53 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3070  chaperone DnaJ domain protein  38.75 
 
 
315 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26301  putative heat shock protein DnaJ  45.9 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  40.28 
 
 
291 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38015  predicted protein  41.94 
 
 
398 aa  56.6  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.964635  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15941  DnaJ-like protein  48.44 
 
 
190 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0326  heat shock protein DnaJ-like  44.12 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0632  heat shock protein DnaJ domain protein  42.19 
 
 
405 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  44.78 
 
 
381 aa  56.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28940  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  43.66 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0918  chaperone protein DnaJ  39.71 
 
 
377 aa  56.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.343225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0592  heat shock protein DnaJ domain protein  43.75 
 
 
406 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0963056  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0404  heat shock protein DnaJ-like protein  46.03 
 
 
310 aa  55.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.203167 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1244  chaperone protein DnaJ  44.93 
 
 
375 aa  55.8  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  42.47 
 
 
388 aa  55.5  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02238  DnaJ domain protein Psi, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07340)  43.94 
 
 
377 aa  55.5  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542195  normal  0.0811515 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0789  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
377 aa  55.5  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1138  chaperone DnaJ-like  41.27 
 
 
325 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2735  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.37 
 
 
315 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.879449  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
381 aa  55.5  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67817  predicted protein  42.42 
 
 
511 aa  55.5  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.695962  normal  0.0282737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1391  heat shock protein DnaJ domain protein  42.86 
 
 
322 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83675  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  32.38 
 
 
388 aa  55.5  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0647  chaperone DnaJ domain protein  48.53 
 
 
337 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0452  heat shock protein DnaJ domain protein  58.33 
 
 
209 aa  55.5  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01401  putative heat shock protein DnaJ  39.29 
 
 
235 aa  55.1  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.634146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
377 aa  55.1  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
375 aa  55.1  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0624  heat shock protein DnaJ  42.86 
 
 
316 aa  54.7  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.541417  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  45.07 
 
 
295 aa  54.7  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2999  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
395 aa  54.7  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.905644  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4473  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 
376 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.264667  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  40.91 
 
 
356 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  45.31 
 
 
311 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2470  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
380 aa  54.3  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03690  chaperone protein DNAJ, putative  43.75 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04970  conserved hypothetical protein  46.38 
 
 
615 aa  54.7  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0262792  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
380 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50996  predicted protein  46.15 
 
 
447 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235436  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26706  predicted protein  40 
 
 
343 aa  54.3  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.676613  hitchhiker  0.00931047 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  40.91 
 
 
359 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  41.27 
 
 
323 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  40.3 
 
 
356 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02638  curved DNA binding protein  45.16 
 
 
299 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3014  heat shock protein DnaJ domain protein  40.62 
 
 
458 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0039  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
377 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553213  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51727  predicted protein  40.85 
 
 
281 aa  53.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01120  chaperone regulator, putative  41.18 
 
 
361 aa  53.9  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_42151  predicted protein  42.11 
 
 
402 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1106  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.32 
 
 
323 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.495657  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.69 
 
 
313 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_7934  predicted protein  42.42 
 
 
66 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
372 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2102  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.57 
 
 
312 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0238412 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1364  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.76 
 
 
293 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
375 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1904  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
391 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1433  DnaJ protein  39.76 
 
 
293 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
374 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1225  chaperone protein DnaJ  37.97 
 
 
378 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.0136736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>