More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1904 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1904  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
391 aa  777    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7057  chaperone protein DnaJ  63.38 
 
 
378 aa  428  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409815  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0839  heat shock protein DnaJ  56.2 
 
 
379 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0215483  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3835  chaperone protein DnaJ  59.05 
 
 
382 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.504584  hitchhiker  0.000855612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3252  chaperone protein DnaJ  59.64 
 
 
376 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199351  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0784  chaperone protein DnaJ  58.99 
 
 
377 aa  395  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0590762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0702  chaperone protein DnaJ  55.84 
 
 
379 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2290  chaperone DnaJ  61.44 
 
 
380 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3455  chaperone protein DnaJ  56.53 
 
 
381 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2110  chaperone protein DnaJ  59.53 
 
 
380 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1972  chaperone protein DnaJ  52.47 
 
 
375 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000781589 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1151  chaperone protein DnaJ  57.91 
 
 
376 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2235  chaperone protein DnaJ  52.44 
 
 
375 aa  381  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0177525  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2209  chaperone DnaJ domain protein  55.15 
 
 
374 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.990749  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13440  chaperone protein DnaJ  54.78 
 
 
372 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2191  chaperone DnaJ domain protein  55.41 
 
 
374 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1265  chaperone DnaJ  58.82 
 
 
379 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0905779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3405  chaperone protein DnaJ  55.81 
 
 
375 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1644  chaperone protein DnaJ  59.13 
 
 
374 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5455  chaperone protein DnaJ  58.25 
 
 
389 aa  364  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13550  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  54.35 
 
 
385 aa  362  7.0000000000000005e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.685498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3836  chaperone protein DnaJ  49.5 
 
 
383 aa  353  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.575279  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1242  chaperone DnaJ domain protein  54.94 
 
 
384 aa  352  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0347494  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2702  chaperone protein DnaJ  53.31 
 
 
381 aa  352  8.999999999999999e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1749  chaperone DnaJ domain protein  54.66 
 
 
375 aa  351  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.378559  normal  0.79074 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12398  chaperone protein DnaJ  52.16 
 
 
382 aa  351  1e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000162557  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1549  chaperone DnaJ domain protein  54.9 
 
 
372 aa  350  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3459  chaperone protein DnaJ  49.63 
 
 
384 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3522  chaperone protein DnaJ  49.63 
 
 
384 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.495865  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3470  chaperone protein DnaJ  49.63 
 
 
384 aa  346  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11700  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  55.61 
 
 
376 aa  342  5.999999999999999e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482497  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1572  chaperone DnaJ domain protein  53.52 
 
 
386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.0160005 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12360  chaperone protein DnaJ  52.96 
 
 
377 aa  327  3e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0467451  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  46.94 
 
 
377 aa  311  9e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17290  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  48.58 
 
 
375 aa  305  8.000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2765  chaperone protein DnaJ  49.5 
 
 
389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137899  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  42.72 
 
 
388 aa  301  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  44.06 
 
 
386 aa  296  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  45.13 
 
 
373 aa  295  9e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  46.62 
 
 
374 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  47.24 
 
 
382 aa  293  5e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  44.36 
 
 
370 aa  293  5e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  45.41 
 
 
377 aa  293  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  42.53 
 
 
375 aa  292  7e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  44.22 
 
 
373 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  42.64 
 
 
376 aa  290  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  46.1 
 
 
376 aa  289  6e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  45.29 
 
 
374 aa  289  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  46.1 
 
 
376 aa  289  6e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  46.1 
 
 
376 aa  289  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  46.1 
 
 
376 aa  289  7e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  46.1 
 
 
376 aa  289  7e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  46.1 
 
 
376 aa  289  7e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  46.1 
 
 
376 aa  289  7e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  46.1 
 
 
376 aa  288  9e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  46.1 
 
 
376 aa  288  9e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  43.53 
 
 
379 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  43.53 
 
 
379 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  43.53 
 
 
379 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  43.53 
 
 
379 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  44.39 
 
 
374 aa  287  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  43.53 
 
 
379 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  42.96 
 
 
377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  42.39 
 
 
380 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  43.44 
 
 
356 aa  286  5e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  42.72 
 
 
377 aa  286  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  44.08 
 
 
375 aa  285  8e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  44.1 
 
 
370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  44.92 
 
 
376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  44.42 
 
 
376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  45.32 
 
 
379 aa  283  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  44.81 
 
 
378 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  44.81 
 
 
378 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  44.81 
 
 
378 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  44.81 
 
 
378 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  45.32 
 
 
379 aa  282  6.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
378 aa  282  6.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  45.06 
 
 
378 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  45.06 
 
 
378 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  40.99 
 
 
388 aa  282  9e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  44.67 
 
 
376 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  44.67 
 
 
376 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  44.67 
 
 
376 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  43.54 
 
 
382 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2577  chaperone protein DnaJ  43.46 
 
 
385 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00027839 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  42.96 
 
 
382 aa  281  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  42.36 
 
 
378 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3162  chaperone DnaJ domain protein  47.63 
 
 
387 aa  280  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.354519  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  44.42 
 
 
376 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  44.42 
 
 
376 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  44.42 
 
 
376 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  44.42 
 
 
376 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  42.68 
 
 
379 aa  279  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  43.29 
 
 
356 aa  278  1e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  44.59 
 
 
376 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  45.2 
 
 
378 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  42.55 
 
 
373 aa  277  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  41.22 
 
 
383 aa  278  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  43.49 
 
 
386 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>