More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28940 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_28940  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  100 
 
 
209 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  53.62 
 
 
372 aa  72  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0619  chaperone protein DnaJ  48.53 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0096  chaperone DnaJ domain protein  47.62 
 
 
310 aa  68.2  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.274204 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0918  chaperone protein DnaJ  36 
 
 
377 aa  68.2  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.343225 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0426  putative chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 
313 aa  68.2  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0418  chaperone protein DnaJ, putative  48.48 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2209  chaperone DnaJ domain protein  50.77 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.990749  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4805  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1148  chaperone protein DnaJ  42.42 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.697031  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0451  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1134  chaperone protein DnaJ  45.59 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  46.97 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1972  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1645  chaperone protein DnaJ  47.69 
 
 
383 aa  65.5  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0266103  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  39 
 
 
382 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4354  chaperone DnaJ-like  50.79 
 
 
396 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0404  heat shock protein DnaJ-like protein  51.52 
 
 
310 aa  65.1  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.203167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4767  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.03 
 
 
328 aa  65.1  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272795  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0231  chaperone DnaJ domain-containing protein  49.21 
 
 
393 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208592  normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0534  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.45 
 
 
318 aa  64.7  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449663  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
381 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5925  heat shock protein DnaJ domain protein  49.21 
 
 
279 aa  64.7  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00171  chaperone protein DnaJ  44.62 
 
 
377 aa  64.7  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0387416 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  41.94 
 
 
316 aa  64.3  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01135  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
381 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 
387 aa  64.3  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00670  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  47.54 
 
 
321 aa  64.3  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.772796  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  37 
 
 
379 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  48.44 
 
 
325 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10357  chaperone protein DnaJ  47.69 
 
 
395 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0119746  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  37 
 
 
379 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2470  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
380 aa  63.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  37 
 
 
379 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  43.75 
 
 
299 aa  63.5  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.01 
 
 
315 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  44.62 
 
 
313 aa  62.8  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3820  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
378 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  42.65 
 
 
374 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2102  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.97 
 
 
312 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0238412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 
380 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  44.62 
 
 
376 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0364  chaperone protein DnaJ  46.27 
 
 
389 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154064  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0589  heat shock protein DnaJ domain protein  41.18 
 
 
347 aa  62.8  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00109481  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0796  chaperone protein DnaJ  44.93 
 
 
397 aa  63.2  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.751342 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  44.26 
 
 
336 aa  62.8  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5232  chaperone protein DnaJ  46.97 
 
 
380 aa  62.8  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11700  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  47.06 
 
 
376 aa  62.8  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482497  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  41.27 
 
 
379 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0009  chaperone protein DnaJ  45.31 
 
 
376 aa  62.4  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0447538  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  41.27 
 
 
379 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00161  chaperone protein DnaJ  41.54 
 
 
376 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.296062  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1344  chaperone protein DnaJ  41.54 
 
 
376 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0379  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 
376 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0451  chaperone protein DnaJ  46.38 
 
 
371 aa  62.4  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.240923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1070  heat shock protein DnaJ domain protein  46.97 
 
 
310 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  37.86 
 
 
378 aa  62  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
404 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  46.97 
 
 
385 aa  62  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00161  chaperone protein DnaJ  43.08 
 
 
374 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.108884  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  45.31 
 
 
374 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  43.94 
 
 
359 aa  62  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  45.31 
 
 
371 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  45.31 
 
 
374 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3405  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
375 aa  62  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0562  chaperone protein DnaJ  45.31 
 
 
376 aa  61.6  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.818243  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00161  chaperone protein DnaJ  43.08 
 
 
374 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.453934  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6481  heat shock protein DnaJ domain protein  50 
 
 
383 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0017  chaperone protein DnaJ  43.08 
 
 
374 aa  62  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.629489  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  48.48 
 
 
323 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1151  chaperone protein DnaJ  47.62 
 
 
376 aa  62  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
380 aa  62  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2843  chaperone protein DnaJ  46.38 
 
 
373 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0115  chaperone protein DnaJ  46.27 
 
 
390 aa  61.6  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1225  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 
378 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.0136736 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  43.08 
 
 
376 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  34 
 
 
379 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  34 
 
 
379 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1391  heat shock protein DnaJ domain protein  46.97 
 
 
322 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83675  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  34 
 
 
379 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  34 
 
 
379 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  43.08 
 
 
376 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  44.62 
 
 
382 aa  61.6  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  34 
 
 
379 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.62 
 
 
319 aa  61.6  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  42.42 
 
 
297 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  35.29 
 
 
381 aa  61.6  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  43.08 
 
 
376 aa  61.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
366 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  37.88 
 
 
296 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
388 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.94 
 
 
324 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.94 
 
 
315 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0049  heat shock protein DnaJ-like  48.48 
 
 
325 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf297  heat shock protein DnaJ  36.96 
 
 
369 aa  61.2  0.00000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.302595  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0655  chaperone DnaJ-like protein  46.97 
 
 
305 aa  60.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.610813  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3177  heat shock protein DnaJ-like protein  46.15 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  43.08 
 
 
376 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  43.08 
 
 
376 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>