More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0796 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0796  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
397 aa  813    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.751342 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07680  chaperone protein DnaJ  47.24 
 
 
373 aa  329  4e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.447562 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1647  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
379 aa  329  5.0000000000000004e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51193  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10330  chaperone protein DnaJ  48.04 
 
 
375 aa  300  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0686048  unclonable  0.00000000184085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  41.76 
 
 
373 aa  272  8.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  41.48 
 
 
380 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  40.85 
 
 
356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  40.28 
 
 
356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  41.67 
 
 
377 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  39.89 
 
 
375 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0942  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  41.6 
 
 
377 aa  263  3e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.122373  normal  0.06017 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
381 aa  262  8.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  38.96 
 
 
359 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
382 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  40.6 
 
 
384 aa  259  4e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  42.22 
 
 
386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1208  chaperone protein DnaJ  44.51 
 
 
373 aa  258  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.827822  hitchhiker  0.00896971 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0164  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 
377 aa  255  9e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  37.47 
 
 
386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  40.86 
 
 
385 aa  251  1e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  40.46 
 
 
375 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  38.3 
 
 
377 aa  249  5e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  36.97 
 
 
374 aa  249  5e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  40.11 
 
 
370 aa  249  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0098  chaperone protein DnaJ  40.79 
 
 
379 aa  249  8e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0620001  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0839  heat shock protein DnaJ  39.28 
 
 
379 aa  249  8e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0215483  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0211  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
385 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2074  chaperone protein DnaJ  39.34 
 
 
376 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  39.16 
 
 
379 aa  247  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  40.22 
 
 
376 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  40.22 
 
 
376 aa  246  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  40.22 
 
 
376 aa  246  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  40.22 
 
 
376 aa  246  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  40.22 
 
 
376 aa  246  6e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  40.22 
 
 
376 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00171  chaperone protein DnaJ  37.79 
 
 
377 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0387416 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  40.22 
 
 
376 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  39.94 
 
 
376 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2702  chaperone protein DnaJ  40.33 
 
 
381 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  38.95 
 
 
388 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  40.22 
 
 
376 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  39.48 
 
 
374 aa  245  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  36.89 
 
 
373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  39.89 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  39.89 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  40.17 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  39.89 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  41.9 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  41.9 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  40.17 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  39.89 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13550  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  41.42 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.685498 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  39.89 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  40.17 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  41.44 
 
 
382 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  37.37 
 
 
379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0379  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  37.37 
 
 
379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1060  chaperone protein DnaJ  42.58 
 
 
380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00149105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  37.89 
 
 
379 aa  242  7e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  38.68 
 
 
366 aa  242  9e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  36.54 
 
 
375 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2348  chaperone protein DnaJ  40.11 
 
 
380 aa  242  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  39.31 
 
 
370 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  41.08 
 
 
382 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  38.16 
 
 
375 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  41.23 
 
 
373 aa  241  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  37.8 
 
 
394 aa  241  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  40.4 
 
 
382 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  38.59 
 
 
359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  40.7 
 
 
384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  36.71 
 
 
395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0127  chaperone DnaJ  39.23 
 
 
378 aa  239  4e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  37.05 
 
 
376 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
381 aa  239  8e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00161  chaperone protein DnaJ  38.04 
 
 
374 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2110  chaperone protein DnaJ  40.67 
 
 
380 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00161  chaperone protein DnaJ  39.89 
 
 
376 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.296062  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3209  chaperone protein DnaJ  38.06 
 
 
385 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492328  normal  0.368243 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0017  chaperone protein DnaJ  37.82 
 
 
374 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.629489  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3836  chaperone protein DnaJ  39.23 
 
 
383 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.575279  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  39.27 
 
 
372 aa  237  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4095  chaperone protein DnaJ  40.83 
 
 
376 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  39.74 
 
 
375 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  38.61 
 
 
379 aa  237  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1344  chaperone protein DnaJ  39.89 
 
 
376 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  39.74 
 
 
380 aa  236  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1511  chaperone protein DnaJ  39.6 
 
 
368 aa  236  7e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.577618  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0071  molecular chaperone, heat shock protein  39.33 
 
 
379 aa  236  7e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  38.5 
 
 
374 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2529  chaperone protein DnaJ  37.92 
 
 
379 aa  235  9e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  36.51 
 
 
388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  38.14 
 
 
380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0430  chaperone protein DnaJ  39.74 
 
 
379 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  38.12 
 
 
385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  37.7 
 
 
373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  37.73 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  39.83 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0087  chaperone protein DnaJ  38.63 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.60044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>