More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3177 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3177  heat shock protein DnaJ-like protein  100 
 
 
261 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  54.67 
 
 
386 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  56.25 
 
 
372 aa  75.1  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  52.46 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  52 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  50.72 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0839  heat shock protein DnaJ  56.06 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0215483  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  52.17 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  50.72 
 
 
375 aa  72.8  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13440  chaperone protein DnaJ  59.02 
 
 
372 aa  72.4  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1001  heat shock protein DnaJ domain protein  53.03 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  54.41 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  54.41 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  56.25 
 
 
382 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  52.94 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  48.48 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  57.14 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  50.77 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6481  heat shock protein DnaJ domain protein  59.02 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3252  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199351  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  53.12 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  52.94 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7057  chaperone protein DnaJ  56.25 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409815  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  42.02 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1749  chaperone DnaJ domain protein  54.84 
 
 
375 aa  68.9  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.378559  normal  0.79074 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  54.69 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0451  chaperone protein DnaJ  51.61 
 
 
375 aa  68.9  0.00000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  53.12 
 
 
379 aa  68.6  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  47.83 
 
 
388 aa  68.6  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  46.27 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  49.28 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  53.97 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  53.97 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  49.28 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  49.23 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1244  chaperone protein DnaJ  46.48 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1000  heat shock protein DnaJ domain protein  51.52 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  34.65 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0034  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0647  chaperone DnaJ domain protein  59.68 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0078  chaperone protein DnaJ  50.75 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000211475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  46.38 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  54.69 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  44.62 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0096  chaperone DnaJ domain protein  45.59 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.274204 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0078  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0264458  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3806  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.44 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0737  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.82 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.649891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5061  chaperone DnaJ domain protein  46.88 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  49.28 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0681  chaperone protein DnaJ  51.47 
 
 
386 aa  67  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.034617  normal  0.293226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
380 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  47.14 
 
 
404 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0379  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16800  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  53.23 
 
 
372 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal  0.640022 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  46.97 
 
 
298 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0023  chaperone protein DnaJ  39.18 
 
 
384 aa  67  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2614  heat shock protein DnaJ domain protein  49.28 
 
 
292 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1768  heat shock protein DnaJ-like  41.67 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0454464  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0784  chaperone protein DnaJ  54.84 
 
 
377 aa  67  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0590762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2290  chaperone DnaJ  54.84 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  51.56 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  47.83 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  50 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1003  heat shock protein DnaJ domain protein  49.21 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  47.14 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  46.03 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01361  putative heat shock protein DnaJ  42.86 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.105788  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6927  heat shock protein DnaJ domain protein  53.73 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.249011  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2374  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.78 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641958  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.45 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1151  chaperone protein DnaJ  54.84 
 
 
376 aa  65.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0087  chaperone protein DnaJ  49.23 
 
 
373 aa  65.9  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.60044  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  52.24 
 
 
375 aa  65.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
377 aa  65.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4476  heat shock protein DnaJ domain protein  47.06 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00486876 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  48.53 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3070  chaperone DnaJ domain protein  48.48 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1265  chaperone DnaJ  56.67 
 
 
379 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0905779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0231  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.56 
 
 
393 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208592  normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  39.05 
 
 
330 aa  65.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
380 aa  65.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0702  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
379 aa  65.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  53.12 
 
 
400 aa  65.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0675  heat shock protein  31.82 
 
 
276 aa  64.7  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.745295  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  50.79 
 
 
328 aa  65.1  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
374 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01135  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
381 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  38.3 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3589  heat shock protein DnaJ domain protein  54.84 
 
 
324 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0561803  normal  0.0551979 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  44.12 
 
 
335 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1691  chaperone protein DnaJ  53.12 
 
 
401 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.211452  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0535  chaperone protein DnaJ  48.44 
 
 
379 aa  64.7  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0979  chaperone DnaJ-like  42.68 
 
 
401 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109475 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
374 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0589  heat shock protein DnaJ domain protein  35.71 
 
 
347 aa  65.1  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00109481  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 
387 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  51.56 
 
 
385 aa  65.1  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>