More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1265 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1265  chaperone DnaJ  100 
 
 
379 aa  749    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0905779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2110  chaperone protein DnaJ  87.78 
 
 
380 aa  593  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3252  chaperone protein DnaJ  66.94 
 
 
376 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199351  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0784  chaperone protein DnaJ  66.4 
 
 
377 aa  456  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0590762 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0839  heat shock protein DnaJ  59.52 
 
 
379 aa  443  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0215483  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1644  chaperone protein DnaJ  68.35 
 
 
374 aa  438  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1151  chaperone protein DnaJ  63.44 
 
 
376 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3835  chaperone protein DnaJ  63.16 
 
 
382 aa  433  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.504584  hitchhiker  0.000855612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7057  chaperone protein DnaJ  63.66 
 
 
378 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409815  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3455  chaperone protein DnaJ  64.72 
 
 
381 aa  429  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13550  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  62.02 
 
 
385 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.685498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2702  chaperone protein DnaJ  62.39 
 
 
381 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0702  chaperone protein DnaJ  58.82 
 
 
379 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1972  chaperone protein DnaJ  54.67 
 
 
375 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000781589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3836  chaperone protein DnaJ  60.5 
 
 
383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.575279  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2290  chaperone DnaJ  62.37 
 
 
380 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12398  chaperone protein DnaJ  59.07 
 
 
382 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000162557  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13440  chaperone protein DnaJ  57.03 
 
 
372 aa  401  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2235  chaperone protein DnaJ  54.47 
 
 
375 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0177525  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5455  chaperone protein DnaJ  63.71 
 
 
389 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1242  chaperone DnaJ domain protein  61.96 
 
 
384 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0347494  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2191  chaperone DnaJ domain protein  58.47 
 
 
374 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2209  chaperone DnaJ domain protein  56.3 
 
 
374 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.990749  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3459  chaperone protein DnaJ  58.44 
 
 
384 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3470  chaperone protein DnaJ  58.44 
 
 
384 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3522  chaperone protein DnaJ  58.44 
 
 
384 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.495865  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1549  chaperone DnaJ domain protein  58.65 
 
 
372 aa  386  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1572  chaperone DnaJ domain protein  61.01 
 
 
386 aa  375  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.0160005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3405  chaperone protein DnaJ  55.12 
 
 
375 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11700  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  56.22 
 
 
376 aa  358  7e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482497  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1749  chaperone DnaJ domain protein  54.96 
 
 
375 aa  355  7.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.378559  normal  0.79074 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3162  chaperone DnaJ domain protein  54.83 
 
 
387 aa  347  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.354519  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2765  chaperone protein DnaJ  56.81 
 
 
389 aa  346  5e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137899  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0900  putative chaperone protein DnaJ  44.82 
 
 
383 aa  323  3e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17290  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  50.42 
 
 
375 aa  315  6e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  48.43 
 
 
373 aa  315  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  46.8 
 
 
370 aa  310  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  44.77 
 
 
376 aa  308  8e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  45.11 
 
 
386 aa  308  9e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1904  chaperone protein DnaJ  55.13 
 
 
391 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  47.7 
 
 
374 aa  305  9.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  45.78 
 
 
381 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  47.89 
 
 
374 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  45.89 
 
 
377 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  46.76 
 
 
373 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  45.96 
 
 
370 aa  302  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  43.72 
 
 
388 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  45.15 
 
 
379 aa  299  5e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12360  chaperone protein DnaJ  49.73 
 
 
377 aa  299  7e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0467451  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
375 aa  298  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  44.21 
 
 
375 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  46.4 
 
 
382 aa  296  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  40.9 
 
 
374 aa  296  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  47.75 
 
 
379 aa  296  4e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  41.92 
 
 
380 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  46.61 
 
 
373 aa  295  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  44.94 
 
 
377 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  45.81 
 
 
376 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  46.44 
 
 
376 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  43.84 
 
 
356 aa  293  5e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  44.82 
 
 
375 aa  292  7e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  45.89 
 
 
378 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  45.89 
 
 
378 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  45.89 
 
 
378 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3209  chaperone protein DnaJ  44.66 
 
 
385 aa  291  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492328  normal  0.368243 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  46.18 
 
 
378 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  46.18 
 
 
378 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  45.53 
 
 
376 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  45.53 
 
 
376 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  45.89 
 
 
378 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  45.53 
 
 
376 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  46.43 
 
 
384 aa  290  4e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  45.89 
 
 
372 aa  289  6e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1511  chaperone protein DnaJ  45.8 
 
 
368 aa  289  6e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.577618  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  44.57 
 
 
376 aa  288  8e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  44.82 
 
 
382 aa  288  9e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  45.25 
 
 
376 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  45.25 
 
 
376 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  45.25 
 
 
376 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  45.25 
 
 
376 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  45.76 
 
 
379 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  45.74 
 
 
377 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0444  DnaJ-class molecular chaperone  45.21 
 
 
381 aa  287  2e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.771058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  46.42 
 
 
374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  45.63 
 
 
380 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  43.27 
 
 
356 aa  286  4e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1454  chaperone protein DnaJ  45.51 
 
 
368 aa  286  4e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  43.8 
 
 
388 aa  286  5e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  44.48 
 
 
381 aa  285  7e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  44.32 
 
 
381 aa  285  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  42.98 
 
 
359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  39.89 
 
 
379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  46.99 
 
 
372 aa  282  8.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  44.99 
 
 
378 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  41.76 
 
 
377 aa  280  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  44.67 
 
 
375 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  45.71 
 
 
378 aa  279  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  45.04 
 
 
378 aa  279  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  44.35 
 
 
380 aa  279  6e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  43.73 
 
 
375 aa  278  8e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>