More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1691 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1691  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
401 aa  817    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.211452  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  82.34 
 
 
395 aa  659    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  80.55 
 
 
394 aa  652    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1487  chaperone protein DnaJ  77 
 
 
382 aa  594  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.992778  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  75.25 
 
 
395 aa  594  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1422  chaperone protein DnaJ  75.62 
 
 
400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.234078  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1582  chaperone protein DnaJ  72.57 
 
 
395 aa  566  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0071  molecular chaperone, heat shock protein  48.87 
 
 
379 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3209  chaperone protein DnaJ  49.5 
 
 
385 aa  378  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492328  normal  0.368243 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  48.75 
 
 
385 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6905  chaperone protein DnaJ  49.26 
 
 
389 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.725874  normal  0.252864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4973  chaperone protein DnaJ  47.25 
 
 
386 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0482542  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  44.25 
 
 
379 aa  350  3e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1521  chaperone protein DnaJ  46.63 
 
 
388 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173202  normal  0.704316 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  43.66 
 
 
386 aa  319  6e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  42.68 
 
 
386 aa  318  7e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  44.64 
 
 
379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  45.89 
 
 
382 aa  313  3.9999999999999997e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  46.13 
 
 
380 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  41.6 
 
 
375 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  41.23 
 
 
386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  43 
 
 
380 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  41.75 
 
 
376 aa  300  4e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  43.25 
 
 
382 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  43.24 
 
 
375 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  41.36 
 
 
388 aa  298  8e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  42.26 
 
 
384 aa  298  8e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  41.65 
 
 
379 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  41.65 
 
 
379 aa  297  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  41.65 
 
 
379 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  41.29 
 
 
379 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  41.29 
 
 
379 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  41.29 
 
 
379 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  41.29 
 
 
379 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  41.29 
 
 
379 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  41.35 
 
 
373 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  41.11 
 
 
374 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  42.54 
 
 
377 aa  294  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  44.86 
 
 
385 aa  294  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  42.97 
 
 
370 aa  294  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  42.79 
 
 
373 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  43.61 
 
 
375 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  41.04 
 
 
376 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  41.04 
 
 
376 aa  293  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  42.39 
 
 
381 aa  293  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  41.04 
 
 
376 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  41.04 
 
 
376 aa  293  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  41.04 
 
 
376 aa  293  5e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  41.04 
 
 
376 aa  293  5e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  41.04 
 
 
376 aa  293  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  41.04 
 
 
376 aa  293  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  40.5 
 
 
376 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  40.9 
 
 
378 aa  293  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  43.39 
 
 
384 aa  292  6e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  40.8 
 
 
376 aa  292  7e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  40.45 
 
 
375 aa  292  7e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  43.22 
 
 
375 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  40.65 
 
 
378 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
369 aa  291  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  40.64 
 
 
381 aa  290  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0097  chaperone protein DnaJ  42.02 
 
 
361 aa  291  2e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00841674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  40.9 
 
 
375 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  40.5 
 
 
378 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  42.96 
 
 
374 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  40.25 
 
 
378 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  42.5 
 
 
378 aa  288  8e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  40.25 
 
 
378 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  40.5 
 
 
378 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  40.5 
 
 
378 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  40.25 
 
 
378 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  39.8 
 
 
374 aa  288  9e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  39.9 
 
 
380 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  42.71 
 
 
374 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  40.25 
 
 
377 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  41.5 
 
 
374 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  42.54 
 
 
373 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  43.42 
 
 
374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
382 aa  286  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  42.5 
 
 
378 aa  286  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  40.79 
 
 
356 aa  286  5.999999999999999e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  43.54 
 
 
387 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  41 
 
 
376 aa  285  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  43.54 
 
 
387 aa  285  7e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  42.67 
 
 
370 aa  285  8e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  41.21 
 
 
356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  42.21 
 
 
374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  41.58 
 
 
382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  44.14 
 
 
374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  42.96 
 
 
380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  39.75 
 
 
377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  40.69 
 
 
382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  40.69 
 
 
382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  44.17 
 
 
376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3554  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.562407  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5050  chaperone protein DnaJ  43.89 
 
 
368 aa  283  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  41.29 
 
 
379 aa  282  9e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  41.29 
 
 
379 aa  282  9e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0455  chaperone protein DnaJ  40.55 
 
 
373 aa  282  9e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  40.25 
 
 
376 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  40.25 
 
 
376 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>