More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0511 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0511  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 		 352 aa  700    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.389255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0632  heat shock protein DnaJ domain protein  50 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0592  heat shock protein DnaJ domain protein  48.39 
 
 		 406 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0963056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1023  molecular chaperone DnaJ family  42.63 
 
 		 429 aa  173  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0395  DnaJ family protein  29.48 
 
 		 299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.460833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2626  chaperone DnaJ  31.64 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0726  heat shock protein DnaJ-like  29.48 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.749707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  29.97 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  30.29 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  28.65 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  30.7 
 
 		 301 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3756  chaperone DnaJ domain protein  29.74 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144463  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  27.76 
 
 		 334 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  27.83 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0418  chaperone protein DnaJ, putative  37.42 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0426  putative chaperone protein DnaJ  37.42 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  28.53 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  25.22 
 
 		 301 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  27.33 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  29.62 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  28.87 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1165  chaperone protein DnaJ  25.96 
 
 		 372 aa  109  6e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0534  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.58 
 
 		 318 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449663  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02921  DnaJ3 protein  25.75 
 
 		 311 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1086  chaperone DnaJ domain protein  37.34 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1582  heat shock protein DnaJ, N-terminal  26.35 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.814201  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  26.41 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  24.79 
 
 		 333 aa  106  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  26.28 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  28.12 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  28.02 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1106  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.67 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.495657  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  27.51 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  28.2 
 
 		 306 aa  103  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  27.1 
 
 		 380 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  28.2 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  27.57 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  28.28 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  27.57 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  27.57 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  28.28 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  27.57 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  27.57 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.898218 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  27.99 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  27.99 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  27.99 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  29.8 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  27.99 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2102  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.55 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0238412 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  27.99 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  26.28 
 
 		 294 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1138  chaperone DnaJ-like  34.16 
 
 		 325 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  24.29 
 
 		 309 aa  99.8  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  28.27 
 
 		 315 aa  99.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  27.58 
 
 		 356 aa  99.4  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2465  putative heat shock (dnaJ-kile)  34.78 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  28.92 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  23.89 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  28.01 
 
 		 356 aa  96.3  8e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1244  chaperone protein DnaJ  24.24 
 
 		 375 aa  96.3  8e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  26.87 
 
 		 313 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  24.71 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  26.52 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.84 
 
 		 313 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1000  heat shock protein DnaJ domain protein  26.21 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  27.76 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07680  chaperone protein DnaJ  27.08 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.447562 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  27.81 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0767  chaperone DnaJ-like  34.78 
 
 		 319 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.937963  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.27 
 
 		 317 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  25.53 
 
 		 307 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5524  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.12 
 
 		 308 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0904  DnaJ-class molecular chaperone  25.3 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1309  chaperone DnaJ-like  33.53 
 
 		 323 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1391  heat shock protein DnaJ domain protein  35.37 
 
 		 322 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83675  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  27.76 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  24.86 
 
 		 379 aa  92  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  27.25 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  30.25 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  27.51 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.71 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0624  heat shock protein DnaJ  32.92 
 
 		 316 aa  90.5  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.541417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  26.47 
 
 		 377 aa  90.5  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  26.76 
 
 		 359 aa  90.5  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  26.53 
 
 		 314 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  26.94 
 
 		 330 aa  90.1  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  26.02 
 
 		 381 aa  89.4  9e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0006  chaperone protein DnaJ  27.84 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.359061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1003  heat shock protein DnaJ domain protein  23.91 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0351  chaperone DnaJ domain protein  26.23 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.697421 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  27.01 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  25 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  25.89 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  24.43 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  25 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.97 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02351  DnaJ-like molecular chaperone  25.58 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  27.25 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1070  heat shock protein DnaJ domain protein  33.93 
 
 		 310 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  25.77 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>