93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1905 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1905  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  386  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4084  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.71 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000392536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00181  DnaJ-related protein  30.6 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0687  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.19 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365833 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0483  heat shock protein DnaJ-like  30.48 
 
 		 206 aa  70.9  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000132964  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0965  heat shock protein DnaJ domain protein  31.54 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3397  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.54 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.330365  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.54 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831505  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0976  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.54 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3035  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.87 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3062  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.87 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0198351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.87 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.634655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0875  formate dehydrogenase  30.87 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  0.42894 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3716  DnaJ domain-containing protein  30.87 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  28.28 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3786  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.29 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2268  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.72 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2963  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.68 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.954883  normal  0.0137072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0797  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.49 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0724  heat shock protein DnaJ-like protein  28 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2497  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.99 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.236473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.84 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2933  heat shock protein DnaJ-like protein  29.68 
 
 		 216 aa  60.8  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.548763  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0725  putative DnaJ-related protein  29.53 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4188  hypothetical protein  29.14 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0565  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.97 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0819  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.7 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49040  hypothetical protein  27.22 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414994  hitchhiker  0.000000057782 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000172  DnaJ-related protein  29.53 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1585  heat shock protein DnaJ-like  27.39 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0628  heat shock protein DnaJ domain protein  40.74 
 
 		 363 aa  53.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.636565  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05806  formate dehydrogenase  26.17 
 
 		 206 aa  52.4  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0728  DnaJ family protein  26.11 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_42151  predicted protein  44.68 
 
 		 402 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2883  heat shock protein DnaJ domain protein  43.14 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.936925 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1619  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  42.11 
 
 		 258 aa  50.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38015  predicted protein  42.55 
 
 		 398 aa  48.9  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.964635  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5342  heat shock protein DnaJ domain protein  41.51 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3451  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.55 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.658734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  35.85 
 
 		 336 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3191  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 		 375 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2928  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 		 375 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1072  DnaJ domain-containing protein  41.51 
 
 		 56 aa  46.6  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0676389  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1549  chaperone DnaJ domain protein  44.23 
 
 		 372 aa  45.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5081  heat shock protein DnaJ domain protein  45.45 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.181728  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1945  molecular chaperone DnaJ family  40 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5266  heat shock protein DnaJ domain protein  44 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4799  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.111411 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0096  chaperone DnaJ domain protein  36.17 
 
 		 310 aa  45.4  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.274204 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0976  heat shock protein DnaJ-like  42.55 
 
 		 256 aa  45.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.156674  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1674  hypothetical protein  38.78 
 
 		 338 aa  45.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0353  heat shock protein DnaJ domain protein  39.39 
 
 		 241 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  39.29 
 
 		 316 aa  45.4  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42592  predicted protein  37.25 
 
 		 62 aa  44.7  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0431  ferredoxin  40.43 
 
 		 214 aa  44.7  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00670  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  35.85 
 
 		 321 aa  44.7  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.772796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16800  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  42.86 
 
 		 372 aa  44.7  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal  0.640022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2256  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.68 
 
 		 240 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.404984  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0765  co-chaperone protein DnaJ  38 
 
 		 290 aa  44.3  0.0009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000175229  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6481  heat shock protein DnaJ domain protein  38.46 
 
 		 383 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5385  predicted protein  42 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.117735 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2459  heat shock protein DnaJ domain protein  42.55 
 
 		 314 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000295902 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0452  heat shock protein DnaJ domain protein  42.55 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1364  co-chaperone protein DnaJ  38 
 
 		 297 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0201  dnaJ domain-containing protein  40.43 
 
 		 79 aa  43.5  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.138312  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1243  co-chaperone protein DnaJ  38 
 
 		 297 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000103422  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2499  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.52 
 
 		 253 aa  42.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86775  normal  0.0662441 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_221  molecular chaperone, DnaJ-family  39.34 
 
 		 104 aa  42.4  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_19643  predicted protein  36.17 
 
 		 423 aa  42.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0479063  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0496  co-chaperone protein DnaJ  38 
 
 		 294 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0272184  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0801  heat shock protein DnaJ, N-terminal  36.73 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0974  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.11 
 
 		 316 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583857 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1489  putative heat shock protein DnaJ  32.69 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2389  heat shock protein DnaJ-like  39.13 
 
 		 266 aa  42.4  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464202 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01371  putative heat shock protein DnaJ  34 
 
 		 232 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.333222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4522  Dna-J like membrane chaperone protein  46.15 
 
 		 275 aa  42  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3070  chaperone DnaJ domain protein  33.93 
 
 		 315 aa  42  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01941  putative heat shock protein DnaJ  32.69 
 
 		 217 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6456  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.43 
 
 		 325 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00677011 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1195  heat shock protein DnaJ domain protein  37.25 
 
 		 248 aa  42  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0778  co-chaperone-curved DNA binding protein A  36 
 
 		 288 aa  42  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_9940  predicted protein  38.3 
 
 		 60 aa  41.6  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0433566 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3726  heat shock protein DnaJ domain protein  38.1 
 
 		 121 aa  41.6  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03160  chaperone regulator, putative  43.14 
 
 		 498 aa  41.6  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40349  predicted protein  38.18 
 
 		 198 aa  41.6  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3732  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.73 
 
 		 423 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.143539  normal  0.0525791 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  35.19 
 
 		 380 aa  41.6  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0511  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 		 378 aa  41.6  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.100964  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0791  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.74 
 
 		 253 aa  41.2  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.267414 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0507  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.22 
 
 		 304 aa  41.2  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.830824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.89 
 
 		 292 aa  41.2  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0023  chaperone protein DnaJ  36.54 
 
 		 384 aa  40.8  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>