217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3786 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3786  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
219 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0797  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  78.8 
 
 
219 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0687  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  70.51 
 
 
219 aa  320  9.000000000000001e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3062  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  64.52 
 
 
214 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0198351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  64.52 
 
 
214 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.634655  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0875  formate dehydrogenase  64.52 
 
 
214 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  0.42894 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3716  DnaJ domain-containing protein  64.06 
 
 
214 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3035  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  64.06 
 
 
214 aa  298  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  63.13 
 
 
214 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831505  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0724  heat shock protein DnaJ-like protein  65.44 
 
 
214 aa  296  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0819  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  66.99 
 
 
219 aa  296  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0976  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  63.13 
 
 
214 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0965  heat shock protein DnaJ domain protein  63.13 
 
 
214 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3397  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  63.13 
 
 
214 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.330365  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2933  heat shock protein DnaJ-like protein  62.68 
 
 
216 aa  278  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.548763  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0725  putative DnaJ-related protein  49.51 
 
 
205 aa  202  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000172  DnaJ-related protein  46.31 
 
 
206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0728  DnaJ family protein  45.15 
 
 
209 aa  185  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05806  formate dehydrogenase  46.84 
 
 
206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4084  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.44 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000392536  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1905  hypothetical protein  28.29 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2963  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.05 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.954883  normal  0.0137072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49040  hypothetical protein  31.17 
 
 
197 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414994  hitchhiker  0.000000057782 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1585  heat shock protein DnaJ-like  30.64 
 
 
252 aa  62  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4188  hypothetical protein  29.8 
 
 
197 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.77 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0565  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.79 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00181  DnaJ-related protein  29.63 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0483  heat shock protein DnaJ-like  24.49 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000132964  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  36.73 
 
 
316 aa  52.8  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  26.95 
 
 
201 aa  52.4  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2497  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.39 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.236473  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84519  Molecular chaperone (DnaJ superfamily)  39.13 
 
 
344 aa  50.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35649  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
385 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
386 aa  48.5  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0156  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
377 aa  48.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08256  chaperone protein dnaJ  37.25 
 
 
376 aa  47.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.482747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.38 
 
 
287 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0918  chaperone protein DnaJ  36.84 
 
 
377 aa  47.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.343225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.38 
 
 
289 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0198  chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 
378 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  40.68 
 
 
335 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1230  heat shock protein DnaJ-like  33.33 
 
 
90 aa  47  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  35.59 
 
 
389 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  44.23 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.29 
 
 
283 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0965  chaperone protein DnaJ  40.82 
 
 
380 aa  47  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0652035  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2268  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.1 
 
 
194 aa  47  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  40.68 
 
 
335 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0330  chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 
379 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
376 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  46.51 
 
 
336 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1483  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
373 aa  45.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.387506  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
385 aa  46.2  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0767  chaperone protein DnaJ  38.78 
 
 
379 aa  46.2  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93917  predicted protein  42.31 
 
 
371 aa  46.2  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.370144 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0675  heat shock protein  32.65 
 
 
276 aa  46.2  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.745295  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1309  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.68 
 
 
233 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 
374 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
356 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2869  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
382 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
379 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2463  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
382 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820869  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf297  heat shock protein DnaJ  36 
 
 
369 aa  45.4  0.0006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.302595  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 
376 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26706  predicted protein  38.71 
 
 
343 aa  45.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.676613  hitchhiker  0.00931047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
379 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2572  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
376 aa  45.4  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 
372 aa  45.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
373 aa  45.4  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
380 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  35.09 
 
 
372 aa  45.4  0.0007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  34.69 
 
 
374 aa  45.4  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1225  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
378 aa  45.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.0136736 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  34.69 
 
 
374 aa  45.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
380 aa  45.1  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5232  chaperone protein DnaJ  37.74 
 
 
380 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0352  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
379 aa  45.1  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3820  chaperone protein DnaJ  36.96 
 
 
378 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  34.62 
 
 
379 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  34.62 
 
 
379 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  34.69 
 
 
381 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 
372 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  39.58 
 
 
359 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  37.5 
 
 
356 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 
378 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47446  predicted protein  41.46 
 
 
341 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
376 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 
379 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  34.69 
 
 
379 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 
387 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 
387 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  32.69 
 
 
373 aa  44.7  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1299  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 
371 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1422  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.74 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000419249  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1768  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
380 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
378 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
376 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  35.09 
 
 
373 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 
378 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>