More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0819 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0819  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 		 219 aa  455  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0724  heat shock protein DnaJ-like protein  74.88 
 
 		 214 aa  332  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0875  formate dehydrogenase  71.84 
 
 		 214 aa  324  7e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  0.42894 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3062  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  71.84 
 
 		 214 aa  324  7e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0198351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  71.84 
 
 		 214 aa  324  7e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.634655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3716  DnaJ domain-containing protein  70.39 
 
 		 214 aa  321  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3035  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  70.85 
 
 		 214 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3397  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  72.92 
 
 		 214 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.330365  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0965  heat shock protein DnaJ domain protein  72.92 
 
 		 214 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0976  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  72.92 
 
 		 214 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  72.92 
 
 		 214 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831505  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2933  heat shock protein DnaJ-like protein  69.19 
 
 		 216 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.548763  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3786  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  66.99 
 
 		 219 aa  296  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0797  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  67.71 
 
 		 219 aa  268  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0687  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  57.99 
 
 		 219 aa  266  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365833 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000172  DnaJ-related protein  53.93 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05806  formate dehydrogenase  52.36 
 
 		 206 aa  203  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0725  putative DnaJ-related protein  52.24 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0728  DnaJ family protein  50.53 
 
 		 209 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4084  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.39 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000392536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2963  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.98 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.954883  normal  0.0137072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4188  hypothetical protein  30.05 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0565  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0483  heat shock protein DnaJ-like  28.66 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000132964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49040  hypothetical protein  34 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414994  hitchhiker  0.000000057782 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  27.13 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1905  hypothetical protein  27.7 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2497  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.85 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.236473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.1 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  48.98 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  48.98 
 
 		 359 aa  55.1  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0619  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 		 392 aa  54.7  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  46.94 
 
 		 356 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  40.68 
 
 		 389 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5232  chaperone protein DnaJ  44.26 
 
 		 380 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  46.15 
 
 		 302 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  42.31 
 
 		 376 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  44.23 
 
 		 393 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 		 382 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.37 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf297  heat shock protein DnaJ  44 
 
 		 369 aa  54.3  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.302595  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  48 
 
 		 388 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01135  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 		 381 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 		 361 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0330  chaperone protein DnaJ  44.23 
 
 		 379 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  44.23 
 
 		 381 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  45.1 
 
 		 339 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84519  Molecular chaperone (DnaJ superfamily)  43.48 
 
 		 344 aa  53.5  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0352  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 379 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.15 
 
 		 302 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  45.1 
 
 		 308 aa  52.8  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1299  chaperone protein DnaJ  44.23 
 
 		 371 aa  52.8  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  42.62 
 
 		 376 aa  52.8  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 		 376 aa  52.4  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 		 376 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  43.14 
 
 		 296 aa  52.4  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 		 379 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0767  chaperone protein DnaJ  40.68 
 
 		 379 aa  52.4  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 		 376 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 		 379 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 		 379 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 		 379 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  40.82 
 
 		 316 aa  52.4  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 		 376 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 		 376 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 		 379 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0156  chaperone protein DnaJ  44.23 
 
 		 377 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0009  chaperone protein DnaJ  44.23 
 
 		 376 aa  52.8  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0447538  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 		 376 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  44.23 
 
 		 385 aa  52  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  46.15 
 
 		 378 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0918  chaperone protein DnaJ  38.98 
 
 		 377 aa  52.4  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.343225 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03720  DnaJ domain containing protein  35.59 
 
 		 249 aa  52  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.338466  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  35.59 
 
 		 297 aa  51.6  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0562  chaperone protein DnaJ  44.23 
 
 		 376 aa  51.2  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.818243  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 		 380 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  46.15 
 
 		 380 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2572  chaperone protein DnaJ  40.98 
 
 		 376 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0198  chaperone protein DnaJ  42.31 
 
 		 378 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0351  chaperone DnaJ domain protein  45.1 
 
 		 334 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.697421 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  38.98 
 
 		 372 aa  51.2  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1585  heat shock protein DnaJ-like  28.38 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 		 382 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1225  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 		 378 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.0136736 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04192  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05900)  44.23 
 
 		 634 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.107548  normal  0.45593 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0675  heat shock protein  36.73 
 
 		 276 aa  50.1  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.745295  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2577  chaperone protein DnaJ  42.59 
 
 		 385 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00027839 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 		 385 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  41.18 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 		 372 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2664  chaperone protein DnaJ  42.31 
 
 		 375 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0965  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 380 aa  50.8  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0652035  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0097  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 361 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00841674 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2290  chaperone protein DnaJ  42.31 
 
 		 375 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 		 383 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0765  co-chaperone protein DnaJ  44.68 
 
 		 290 aa  50.1  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000175229  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0096  chaperone DnaJ domain protein  45.83 
 
 		 310 aa  49.7  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.274204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3127  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 380 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82415  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  38.46 
 
 		 376 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>