More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3062 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3062  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 		 214 aa  440  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0198351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 		 214 aa  440  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.634655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0875  formate dehydrogenase  100 
 
 		 214 aa  440  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  0.42894 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3716  DnaJ domain-containing protein  97.66 
 
 		 214 aa  431  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3035  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  92.52 
 
 		 214 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0965  heat shock protein DnaJ domain protein  89.72 
 
 		 214 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3397  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  89.72 
 
 		 214 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.330365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0976  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  89.72 
 
 		 214 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  89.72 
 
 		 214 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831505  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0724  heat shock protein DnaJ-like protein  71.5 
 
 		 214 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0819  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  71.84 
 
 		 219 aa  324  7e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3786  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  64.52 
 
 		 219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2933  heat shock protein DnaJ-like protein  66.83 
 
 		 216 aa  295  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.548763  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0797  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  59.63 
 
 		 219 aa  270  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0687  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  55.76 
 
 		 219 aa  259  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365833 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000172  DnaJ-related protein  48.54 
 
 		 206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0725  putative DnaJ-related protein  50.25 
 
 		 205 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05806  formate dehydrogenase  50.26 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0728  DnaJ family protein  46.83 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4084  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.12 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000392536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1905  hypothetical protein  30.87 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2963  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.16 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.954883  normal  0.0137072 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0483  heat shock protein DnaJ-like  27.03 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000132964  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0565  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.47 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.3 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4188  hypothetical protein  32.65 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  45.76 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  41.94 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  43.75 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  30.71 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49040  hypothetical protein  32.67 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414994  hitchhiker  0.000000057782 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 		 381 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0619  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 		 392 aa  53.5  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84519  Molecular chaperone (DnaJ superfamily)  45.65 
 
 		 344 aa  53.1  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 		 382 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01135  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 		 381 aa  52.8  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.31 
 
 		 302 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2497  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.87 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.236473  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 376 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0330  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 		 379 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 374 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  38.98 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0096  chaperone DnaJ domain protein  45.83 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.274204 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  50 
 
 		 319 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5232  chaperone protein DnaJ  45.28 
 
 		 380 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 374 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 393 aa  50.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 376 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 376 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 379 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 		 377 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  43.14 
 
 		 339 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 376 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 376 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 376 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 379 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 		 385 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 379 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 379 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 379 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1972  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 		 374 aa  49.3  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0156  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 377 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 		 376 aa  48.9  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  47.92 
 
 		 359 aa  48.9  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 382 aa  48.9  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 		 378 aa  48.5  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 		 378 aa  48.5  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1183  chaperone protein DnaJ  40.68 
 
 		 377 aa  48.5  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000246856  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0390  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 386 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  45.65 
 
 		 298 aa  48.5  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  39.22 
 
 		 376 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0562  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 376 aa  48.5  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.818243  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 		 378 aa  48.5  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0198  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 378 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 		 376 aa  48.5  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0430  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 379 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  45.83 
 
 		 356 aa  48.1  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0918  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 		 377 aa  48.5  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.343225 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 		 377 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 		 377 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00181  DnaJ-related protein  24.46 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  47.83 
 
 		 378 aa  48.1  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  47.83 
 
 		 378 aa  48.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 		 377 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 377 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  39.22 
 
 		 376 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  39.22 
 
 		 376 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  39.34 
 
 		 375 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3820  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 		 378 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  39.34 
 
 		 374 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1299  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 		 371 aa  47.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0351  chaperone DnaJ domain protein  43.14 
 
 		 334 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.697421 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0965  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 380 aa  48.1  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0652035  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1230  heat shock protein DnaJ-like  30.91 
 
 		 90 aa  47.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0025  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 		 380 aa  47.8  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  44.07 
 
 		 381 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  36.67 
 
 		 372 aa  47.8  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1585  heat shock protein DnaJ-like  28.67 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  45.1 
 
 		 337 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2470  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 		 380 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>