More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0725 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0725  putative DnaJ-related protein  100 
 
 
205 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000172  DnaJ-related protein  60.42 
 
 
206 aa  254  8e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05806  formate dehydrogenase  58.74 
 
 
206 aa  251  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0728  DnaJ family protein  58.85 
 
 
209 aa  236  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0724  heat shock protein DnaJ-like protein  49.76 
 
 
214 aa  208  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0965  heat shock protein DnaJ domain protein  51.74 
 
 
214 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.74 
 
 
214 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831505  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0976  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.74 
 
 
214 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3397  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.74 
 
 
214 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.330365  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3786  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.51 
 
 
219 aa  202  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0819  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.24 
 
 
219 aa  202  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3035  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.25 
 
 
214 aa  201  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3716  DnaJ domain-containing protein  50.75 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3062  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.25 
 
 
214 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0198351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.25 
 
 
214 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.634655  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0875  formate dehydrogenase  50.25 
 
 
214 aa  199  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  0.42894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0797  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.88 
 
 
219 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2933  heat shock protein DnaJ-like protein  44.98 
 
 
216 aa  192  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.548763  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0687  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.17 
 
 
219 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365833 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4084  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.98 
 
 
192 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000392536  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  28.57 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4188  hypothetical protein  33.56 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0483  heat shock protein DnaJ-like  30 
 
 
206 aa  72  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000132964  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1585  heat shock protein DnaJ-like  28.82 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49040  hypothetical protein  29.53 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414994  hitchhiker  0.000000057782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2963  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.48 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.954883  normal  0.0137072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2497  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.29 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.236473  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0565  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.67 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00181  DnaJ-related protein  28.57 
 
 
227 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1905  hypothetical protein  29.53 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2268  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.87 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  24.54 
 
 
225 aa  58.2  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf297  heat shock protein DnaJ  53.19 
 
 
369 aa  52.8  0.000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.302595  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0535  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
379 aa  53.1  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84519  Molecular chaperone (DnaJ superfamily)  44.19 
 
 
344 aa  53.1  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35649  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0918  chaperone protein DnaJ  47.92 
 
 
377 aa  53.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.343225 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  44.44 
 
 
316 aa  52  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
378 aa  51.6  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0009  chaperone protein DnaJ  47.92 
 
 
376 aa  51.6  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0447538  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0025  chaperone protein DnaJ  45.83 
 
 
380 aa  51.6  0.000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
297 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  47.83 
 
 
356 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  47.92 
 
 
294 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  46.94 
 
 
374 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  48.94 
 
 
336 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  47.83 
 
 
356 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3820  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
378 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  47.83 
 
 
359 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1933  heat shock protein DnaJ-like  42.59 
 
 
97 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0426036  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1645  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
383 aa  49.7  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0266103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3806  chaperone DnaJ domain-containing protein  42 
 
 
328 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  46 
 
 
380 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  44.68 
 
 
361 aa  48.9  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2999  chaperone protein DnaJ  45.83 
 
 
395 aa  48.9  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.905644  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0005  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
382 aa  48.9  0.00006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.68 
 
 
326 aa  48.9  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0619  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
392 aa  48.5  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  45.83 
 
 
377 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0767  chaperone protein DnaJ  47.92 
 
 
379 aa  48.5  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  45.83 
 
 
376 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2577  chaperone protein DnaJ  44 
 
 
385 aa  48.1  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00027839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6905  chaperone protein DnaJ  46.81 
 
 
389 aa  48.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.725874  normal  0.252864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1225  chaperone protein DnaJ  44 
 
 
378 aa  48.1  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.0136736 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
379 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08256  chaperone protein dnaJ  42.86 
 
 
376 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.482747  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
381 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38015  predicted protein  33.93 
 
 
398 aa  47.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.964635  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  42 
 
 
326 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2162  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
367 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  44.68 
 
 
298 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
378 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2855  helix-turn-helix, AraC type  50.94 
 
 
131 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
380 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  47.92 
 
 
377 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1777  heat shock protein DnaJ domain protein  29.9 
 
 
324 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.638873  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
378 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  48.94 
 
 
386 aa  47.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
395 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
376 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1776  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
383 aa  47  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0527  chaperone protein DnaJ  46.34 
 
 
364 aa  47  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  44.68 
 
 
388 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
385 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3070  chaperone DnaJ domain protein  46.81 
 
 
315 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  42 
 
 
380 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
376 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
379 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
372 aa  47.4  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
376 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
389 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
376 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  40.82 
 
 
387 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
376 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  46.81 
 
 
335 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
379 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
376 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
395 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.35 
 
 
302 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  45.83 
 
 
376 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  46.81 
 
 
335 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>