243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05806 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05806  formate dehydrogenase  100 
 
 
206 aa  427  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000172  DnaJ-related protein  74.63 
 
 
206 aa  330  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0728  DnaJ family protein  62.25 
 
 
209 aa  283  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0725  putative DnaJ-related protein  58.74 
 
 
205 aa  251  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0724  heat shock protein DnaJ-like protein  52.08 
 
 
214 aa  203  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0819  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.36 
 
 
219 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0976  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.79 
 
 
214 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.79 
 
 
214 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831505  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0965  heat shock protein DnaJ domain protein  50.79 
 
 
214 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3397  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.79 
 
 
214 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.330365  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3716  DnaJ domain-containing protein  50.79 
 
 
214 aa  198  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3062  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.26 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0198351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.26 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.634655  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3035  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.74 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0875  formate dehydrogenase  50.26 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  0.42894 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2933  heat shock protein DnaJ-like protein  47.98 
 
 
216 aa  193  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.548763  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0797  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.95 
 
 
219 aa  185  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3786  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.84 
 
 
219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0687  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.88 
 
 
219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365833 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4084  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.81 
 
 
192 aa  102  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000392536  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4188  hypothetical protein  34.05 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2963  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.11 
 
 
197 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.954883  normal  0.0137072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49040  hypothetical protein  32.62 
 
 
197 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414994  hitchhiker  0.000000057782 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  31.88 
 
 
201 aa  84.7  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0565  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2497  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.49 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.236473  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0483  heat shock protein DnaJ-like  29.76 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000132964  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.75 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1585  heat shock protein DnaJ-like  29.49 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00181  DnaJ-related protein  32.72 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2268  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.98 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84519  Molecular chaperone (DnaJ superfamily)  44.9 
 
 
344 aa  60.5  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35649  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
379 aa  52.4  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
379 aa  52.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1905  hypothetical protein  26.17 
 
 
185 aa  52.4  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1276  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 
374 aa  52.4  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00131629  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0465  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
374 aa  51.6  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141639  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1396  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
373 aa  51.2  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.427983  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0535  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 
379 aa  51.2  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 
374 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01120  chaperone regulator, putative  45.83 
 
 
361 aa  50.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0493  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
373 aa  50.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0965  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
380 aa  49.7  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0652035  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 
374 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0871  heat shock protein DnaJ  43.14 
 
 
387 aa  50.1  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.255126  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0562  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
376 aa  49.7  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.818243  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0619  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
392 aa  48.5  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1134  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
362 aa  48.5  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
388 aa  48.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 
385 aa  47.8  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0005  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
382 aa  47.4  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  48.84 
 
 
385 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0096  chaperone DnaJ domain protein  47.5 
 
 
310 aa  47.4  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.274204 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0025  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
380 aa  47.8  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0455  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
373 aa  47.8  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  47.83 
 
 
359 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1148  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 
359 aa  47.4  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.697031  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
395 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30941  predicted protein  39.58 
 
 
325 aa  47.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.351185 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0351  chaperone DnaJ domain protein  40 
 
 
334 aa  46.6  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.697421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  41.67 
 
 
298 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  45.65 
 
 
380 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 
374 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1299  chaperone protein DnaJ  34.69 
 
 
371 aa  46.6  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  39.58 
 
 
379 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0040  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
372 aa  45.8  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  38.78 
 
 
372 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0554  heat shock protein DnaJ-like  40.43 
 
 
290 aa  45.8  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  41.18 
 
 
382 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  41.3 
 
 
298 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  39.58 
 
 
379 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1972  chaperone protein DnaJ  34.62 
 
 
374 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5050  chaperone protein DnaJ  40.82 
 
 
368 aa  46.2  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3820  chaperone protein DnaJ  39.13 
 
 
378 aa  45.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_19643  predicted protein  39.58 
 
 
423 aa  45.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0479063  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0145  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 
376 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813386  normal  0.737973 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  38.78 
 
 
376 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  43.48 
 
 
294 aa  45.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  36.96 
 
 
316 aa  45.4  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  47.62 
 
 
302 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 
395 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2290  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
375 aa  45.1  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256335 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1691  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 
401 aa  45.1  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.211452  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf297  heat shock protein DnaJ  36.21 
 
 
369 aa  45.1  0.0007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.302595  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2664  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
375 aa  45.1  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0461  chaperone protein DnaJ  40.82 
 
 
381 aa  45.1  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0918  chaperone protein DnaJ  34.69 
 
 
377 aa  45.1  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.343225 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0527  chaperone protein DnaJ  38.78 
 
 
364 aa  45.1  0.0008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
334 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0156  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 
377 aa  45.1  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 
375 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  35.56 
 
 
373 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  42 
 
 
335 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0430  chaperone protein DnaJ  35.29 
 
 
379 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0330  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 
379 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0390  chaperone protein DnaJ  35.29 
 
 
386 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  35.29 
 
 
379 aa  44.7  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  42 
 
 
335 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1645  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 
383 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0266103  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08256  chaperone protein dnaJ  37.25 
 
 
376 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.482747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>