More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0554 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0554  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 
290 aa  586  1e-166  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1382  heat shock protein DnaJ domain protein  61.07 
 
 
297 aa  336  1.9999999999999998e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.995337  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0805  protein translation intiation inhibitor  53.87 
 
 
296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000779647  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0765  co-chaperone protein DnaJ  51.37 
 
 
290 aa  290  3e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000175229  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0778  co-chaperone-curved DNA binding protein A  54.14 
 
 
288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0976  co-chaperone protein DnaJ  53.63 
 
 
295 aa  285  9e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.984114  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1065  DnaJ domain-containing protein  52.35 
 
 
298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0496  co-chaperone protein DnaJ  50.68 
 
 
294 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0272184  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1364  co-chaperone protein DnaJ  51.18 
 
 
297 aa  261  6.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1243  co-chaperone protein DnaJ  51.18 
 
 
297 aa  261  6.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000103422  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.14 
 
 
315 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  36.52 
 
 
294 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.78 
 
 
324 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.88 
 
 
291 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  35.19 
 
 
311 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.77 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.7 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  35.95 
 
 
307 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.79 
 
 
317 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  36.42 
 
 
323 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  35.56 
 
 
331 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  34.95 
 
 
295 aa  156  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  37.01 
 
 
314 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  36.69 
 
 
314 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  35.9 
 
 
325 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  32.89 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.86 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  33.33 
 
 
287 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  34.81 
 
 
326 aa  152  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  35.05 
 
 
306 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  35.15 
 
 
316 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  33.9 
 
 
299 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  34.1 
 
 
306 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  34.22 
 
 
301 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  31.67 
 
 
315 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  33.77 
 
 
306 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  33.77 
 
 
306 aa  149  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  35.2 
 
 
319 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  33.77 
 
 
306 aa  149  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  33.77 
 
 
306 aa  148  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  33.77 
 
 
306 aa  149  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  33.77 
 
 
306 aa  148  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  33.77 
 
 
306 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.22 
 
 
320 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.75 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  30.64 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.87 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1309  chaperone DnaJ-like  34.19 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0767  chaperone DnaJ-like  33.98 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.937963  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  35.76 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.02 
 
 
339 aa  146  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  34.62 
 
 
308 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.97 
 
 
330 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  34.97 
 
 
306 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  34.97 
 
 
306 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  34.97 
 
 
306 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  34.97 
 
 
306 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  34.62 
 
 
330 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  34.97 
 
 
306 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1433  DnaJ protein  35.48 
 
 
293 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  31.83 
 
 
313 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1391  heat shock protein DnaJ domain protein  35.71 
 
 
322 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83675  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  30.05 
 
 
374 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  32.99 
 
 
302 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1364  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.08 
 
 
293 aa  142  6e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  34.38 
 
 
294 aa  142  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  34.6 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  33.23 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  33.55 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  30.03 
 
 
374 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  33.22 
 
 
294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  33.01 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  34.8 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02921  DnaJ3 protein  33.57 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  31.86 
 
 
324 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  32.89 
 
 
314 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1311  DnaJ-class molecular chaperone  30.03 
 
 
341 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  30.23 
 
 
373 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  34.3 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.04 
 
 
334 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  33.22 
 
 
309 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5524  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.44 
 
 
308 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0203  chaperone DnaJ domain protein  33.33 
 
 
333 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00279971  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1138  chaperone DnaJ-like  33.02 
 
 
325 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1582  heat shock protein DnaJ, N-terminal  32.63 
 
 
311 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.814201  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  32.14 
 
 
315 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  34.84 
 
 
326 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  33.12 
 
 
313 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  32.01 
 
 
301 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02351  DnaJ-like molecular chaperone  34.58 
 
 
312 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3803  heat shock protein DnaJ  36.95 
 
 
293 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  31.1 
 
 
318 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  36.15 
 
 
297 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  30.6 
 
 
307 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0942  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.36 
 
 
377 aa  137  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.122373  normal  0.06017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  30.19 
 
 
318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  33.33 
 
 
296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.61 
 
 
318 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  33.12 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0047  heat shock protein DnaJ-like  32.57 
 
 
330 aa  136  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.940459  normal  0.512662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>