285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2933 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2933  heat shock protein DnaJ-like protein  100 
 
 
216 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.548763  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0724  heat shock protein DnaJ-like protein  67.59 
 
 
214 aa  307  6.999999999999999e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0819  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  69.19 
 
 
219 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3035  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  68.84 
 
 
214 aa  298  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3397  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  67.34 
 
 
214 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.330365  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0965  heat shock protein DnaJ domain protein  67.34 
 
 
214 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0976  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  67.34 
 
 
214 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  67.34 
 
 
214 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831505  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3062  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  66.83 
 
 
214 aa  295  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0198351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  66.83 
 
 
214 aa  295  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.634655  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0875  formate dehydrogenase  66.83 
 
 
214 aa  295  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  0.42894 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3716  DnaJ domain-containing protein  66.33 
 
 
214 aa  294  7e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3786  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  62.68 
 
 
219 aa  278  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0687  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  60 
 
 
219 aa  257  8e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0797  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  59.49 
 
 
219 aa  247  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000172  DnaJ-related protein  47.74 
 
 
206 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0728  DnaJ family protein  48.95 
 
 
209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05806  formate dehydrogenase  47.98 
 
 
206 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0725  putative DnaJ-related protein  44.98 
 
 
205 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4084  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.14 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000392536  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0565  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.1 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49040  hypothetical protein  32.11 
 
 
197 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414994  hitchhiker  0.000000057782 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0483  heat shock protein DnaJ-like  28.19 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000132964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4188  hypothetical protein  32.11 
 
 
197 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1905  hypothetical protein  29.68 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2963  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.41 
 
 
197 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.954883  normal  0.0137072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1585  heat shock protein DnaJ-like  31.33 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2497  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.75 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.236473  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  27.04 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  37.93 
 
 
316 aa  54.3  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0330  chaperone protein DnaJ  48 
 
 
379 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84519  Molecular chaperone (DnaJ superfamily)  43.14 
 
 
344 aa  53.9  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35649  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  24.86 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  38.57 
 
 
339 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  46.94 
 
 
379 aa  52.8  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0096  chaperone DnaJ domain protein  50 
 
 
310 aa  52.4  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.274204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5232  chaperone protein DnaJ  49.02 
 
 
380 aa  51.6  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0156  chaperone protein DnaJ  46 
 
 
377 aa  51.6  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
393 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0198  chaperone protein DnaJ  44 
 
 
378 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  46.94 
 
 
385 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
381 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  47.92 
 
 
356 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
359 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
389 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  45.83 
 
 
356 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  40.82 
 
 
374 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  40.82 
 
 
374 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  44.44 
 
 
287 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0430  chaperone protein DnaJ  42 
 
 
379 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0390  chaperone protein DnaJ  42 
 
 
386 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  40.58 
 
 
302 aa  49.3  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
382 aa  49.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  41.43 
 
 
337 aa  48.9  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0965  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
380 aa  48.9  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0652035  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0351  chaperone DnaJ domain protein  46.94 
 
 
334 aa  48.9  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.697421 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  46 
 
 
387 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  46 
 
 
387 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01135  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
381 aa  48.5  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 
376 aa  48.5  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01120  chaperone regulator, putative  35 
 
 
361 aa  48.1  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0535  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
379 aa  48.1  0.00009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  38.78 
 
 
376 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  36.84 
 
 
308 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  40.82 
 
 
373 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  40.82 
 
 
372 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1225  chaperone protein DnaJ  45.1 
 
 
378 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.0136736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
378 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_002620  TC0619  chaperone protein DnaJ  46.51 
 
 
392 aa  47  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  42.55 
 
 
336 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2572  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 
376 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00181  DnaJ-related protein  28.57 
 
 
227 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  44.19 
 
 
378 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
385 aa  47.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  46.51 
 
 
377 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  35.85 
 
 
373 aa  47  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30941  predicted protein  44.44 
 
 
325 aa  47  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.351185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2765  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
389 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  44.19 
 
 
378 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.84 
 
 
302 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
376 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06170  DnaJ domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08300)  42 
 
 
418 aa  46.2  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.281227 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 
379 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 
376 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 
379 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 
379 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
388 aa  46.6  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 
379 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 
376 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
375 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 
379 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 
376 aa  46.6  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
378 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 
376 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0675  heat shock protein  32.65 
 
 
276 aa  46.6  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.745295  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 
376 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  51.11 
 
 
298 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3820  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
378 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0337  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
379 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 
372 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>