46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2963 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2963  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.954883  normal  0.0137072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4188  hypothetical protein  66.5 
 
 		 197 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49040  hypothetical protein  64.97 
 
 		 197 aa  242  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414994  hitchhiker  0.000000057782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0565  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.78 
 
 		 220 aa  131  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2497  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.33 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.236473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  39.25 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4084  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.71 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000392536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1585  heat shock protein DnaJ-like  30.96 
 
 		 252 aa  98.6  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00181  DnaJ-related protein  32.29 
 
 		 227 aa  95.1  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.21 
 
 		 225 aa  94.7  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0483  heat shock protein DnaJ-like  34.03 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000132964  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05806  formate dehydrogenase  35.11 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2268  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.11 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000172  DnaJ-related protein  35.64 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0819  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.98 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0728  DnaJ family protein  32.45 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0725  putative DnaJ-related protein  30.48 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3035  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0797  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3716  DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0875  formate dehydrogenase  33.16 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  0.42894 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.16 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.634655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3062  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.16 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0198351 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1905  hypothetical protein  32.68 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0965  heat shock protein DnaJ domain protein  34.67 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0976  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.67 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3397  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.67 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.330365  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.67 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831505  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3786  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.05 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0687  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365833 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0724  heat shock protein DnaJ-like protein  33.33 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2933  heat shock protein DnaJ-like protein  30.41 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.548763  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  47.27 
 
 		 258 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0125  putative heat shock protein DnaJ  50 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01391  putative heat shock protein DnaJ  54.29 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.629176  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2364  heat shock protein DnaJ-like  54.29 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.719019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0326  heat shock protein DnaJ-like  54.29 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01401  putative heat shock protein DnaJ  54.29 
 
 		 235 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.634146  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1489  putative heat shock protein DnaJ  47.37 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01941  putative heat shock protein DnaJ  50 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02059  hypothetical protein  30.77 
 
 		 326 aa  42.4  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26301  putative heat shock protein DnaJ  51.43 
 
 		 232 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01371  putative heat shock protein DnaJ  39.58 
 
 		 232 aa  41.6  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.333222 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01361  putative heat shock protein DnaJ  51.43 
 
 		 225 aa  41.6  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.105788  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0976  heat shock protein DnaJ-like  51.28 
 
 		 256 aa  41.6  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.156674  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03463  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G05400)  46.67 
 
 		 519 aa  41.2  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000832444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>