33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0483 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0483  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 
206 aa  422  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000132964  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00181  DnaJ-related protein  31.86 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2963  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.03 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.954883  normal  0.0137072 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  31.37 
 
 
201 aa  88.2  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49040  hypothetical protein  37.16 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414994  hitchhiker  0.000000057782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0565  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.84 
 
 
220 aa  85.9  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1585  heat shock protein DnaJ-like  34.19 
 
 
252 aa  85.5  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4084  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.77 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000392536  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2497  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.87 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.236473  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4188  hypothetical protein  34.46 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05806  formate dehydrogenase  29.76 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0725  putative DnaJ-related protein  30 
 
 
205 aa  72  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1905  hypothetical protein  30.48 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2268  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.66 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000172  DnaJ-related protein  29.61 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0687  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.85 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365833 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0724  heat shock protein DnaJ-like protein  26.75 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3062  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.03 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0198351 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0875  formate dehydrogenase  27.03 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  0.42894 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.03 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.634655  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.22 
 
 
225 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2933  heat shock protein DnaJ-like protein  28.19 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.548763  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0819  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.66 
 
 
219 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3716  DnaJ domain-containing protein  27.03 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3035  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.35 
 
 
214 aa  61.6  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3397  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25 
 
 
214 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.330365  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25 
 
 
214 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831505  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0976  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25 
 
 
214 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0965  heat shock protein DnaJ domain protein  25 
 
 
214 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0797  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.85 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0728  DnaJ family protein  27.04 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3786  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  24.49 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0815  heat shock protein DnaJ domain protein  30.43 
 
 
163 aa  41.6  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>