41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4188 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4188  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49040  hypothetical protein  93.4 
 
 
197 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414994  hitchhiker  0.000000057782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2963  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  66.5 
 
 
197 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.954883  normal  0.0137072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0565  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.96 
 
 
220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2497  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.86 
 
 
223 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.236473  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  41.67 
 
 
201 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.16 
 
 
225 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1585  heat shock protein DnaJ-like  32.63 
 
 
252 aa  101  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4084  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.98 
 
 
192 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000392536  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00181  DnaJ-related protein  33.16 
 
 
227 aa  99.8  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2268  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.16 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05806  formate dehydrogenase  34.05 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000172  DnaJ-related protein  35.81 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0483  heat shock protein DnaJ-like  34.46 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000132964  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0728  DnaJ family protein  33.56 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0725  putative DnaJ-related protein  33.56 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0819  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.05 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0797  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.97 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0724  heat shock protein DnaJ-like protein  31.97 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3035  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 
214 aa  63.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2933  heat shock protein DnaJ-like protein  32.11 
 
 
216 aa  62.4  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.548763  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.97 
 
 
214 aa  61.2  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831505  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3397  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.97 
 
 
214 aa  61.2  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.330365  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0687  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.14 
 
 
219 aa  61.6  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365833 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0965  heat shock protein DnaJ domain protein  31.97 
 
 
214 aa  61.2  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0976  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.97 
 
 
214 aa  61.2  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3786  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.8 
 
 
219 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3716  DnaJ domain-containing protein  32.65 
 
 
214 aa  59.7  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0875  formate dehydrogenase  32.65 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  0.42894 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.65 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.634655  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3062  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.65 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0198351 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1905  hypothetical protein  29.14 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  43.4 
 
 
258 aa  44.7  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0668  DnaJ domain-containing protein  41.82 
 
 
265 aa  44.3  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.165012  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1489  putative heat shock protein DnaJ  40.43 
 
 
216 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01941  putative heat shock protein DnaJ  48.84 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2364  heat shock protein DnaJ-like  43.48 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.719019  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0326  heat shock protein DnaJ-like  44.44 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03463  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G05400)  50 
 
 
519 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000000000832444 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01371  putative heat shock protein DnaJ  39.13 
 
 
232 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.333222 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  46.15 
 
 
336 aa  41.6  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>