More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0687 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0687  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365833 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3786  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  70.51 
 
 
219 aa  320  9.000000000000001e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0797  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  64.22 
 
 
219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0724  heat shock protein DnaJ-like protein  63.82 
 
 
214 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0819  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  57.99 
 
 
219 aa  266  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  57.14 
 
 
214 aa  261  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831505  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0965  heat shock protein DnaJ domain protein  57.14 
 
 
214 aa  261  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3397  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  57.14 
 
 
214 aa  261  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.330365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0976  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  57.14 
 
 
214 aa  261  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3035  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  56.22 
 
 
214 aa  259  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3062  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  55.76 
 
 
214 aa  259  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0198351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  55.76 
 
 
214 aa  259  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.634655  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0875  formate dehydrogenase  55.76 
 
 
214 aa  259  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  0.42894 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3716  DnaJ domain-containing protein  55.3 
 
 
214 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2933  heat shock protein DnaJ-like protein  60 
 
 
216 aa  257  9e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.548763  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000172  DnaJ-related protein  47.34 
 
 
206 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0725  putative DnaJ-related protein  48.17 
 
 
205 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0728  DnaJ family protein  45.41 
 
 
209 aa  185  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05806  formate dehydrogenase  46.88 
 
 
206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4084  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.31 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000392536  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1905  hypothetical protein  30.19 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2497  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.85 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.236473  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0565  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.75 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0483  heat shock protein DnaJ-like  25.85 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000132964  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  30.39 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4188  hypothetical protein  30.14 
 
 
197 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2963  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 
197 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.954883  normal  0.0137072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49040  hypothetical protein  30.41 
 
 
197 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414994  hitchhiker  0.000000057782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.67 
 
 
225 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  45.76 
 
 
372 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  45 
 
 
378 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  40.98 
 
 
381 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
376 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2572  chaperone protein DnaJ  41.27 
 
 
376 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1585  heat shock protein DnaJ-like  25.13 
 
 
252 aa  55.5  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  43.33 
 
 
376 aa  55.5  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
382 aa  55.1  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1225  chaperone protein DnaJ  45.76 
 
 
378 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.0136736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3820  chaperone protein DnaJ  40.68 
 
 
378 aa  54.7  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
378 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
376 aa  55.1  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
377 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
377 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
378 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  42.62 
 
 
378 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
377 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01135  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
381 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
377 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
377 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
377 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
377 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1148  chaperone protein DnaJ  48 
 
 
359 aa  54.7  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.697031  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  39.68 
 
 
389 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0096  chaperone DnaJ domain protein  45.1 
 
 
310 aa  53.9  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.274204 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0965  chaperone protein DnaJ  48 
 
 
380 aa  53.9  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0652035  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0918  chaperone protein DnaJ  36.07 
 
 
377 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.343225 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
376 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0535  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 
379 aa  53.9  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0156  chaperone protein DnaJ  41.38 
 
 
377 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5232  chaperone protein DnaJ  41.94 
 
 
380 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2268  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.41 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  45.28 
 
 
326 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  39.66 
 
 
375 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1968  chaperone protein DnaJ  42.62 
 
 
379 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00646622  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0970  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
376 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
369 aa  52.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 
372 aa  52.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  46.67 
 
 
374 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0198  chaperone protein DnaJ  39.66 
 
 
378 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  45.9 
 
 
376 aa  52.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
376 aa  52.8  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2470  chaperone protein DnaJ  39.34 
 
 
380 aa  52.4  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 
387 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 
387 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  37.7 
 
 
373 aa  52.4  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0562  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
376 aa  52  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.818243  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  42.62 
 
 
380 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  42.62 
 
 
379 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1134  chaperone protein DnaJ  44.23 
 
 
362 aa  52.4  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
374 aa  51.6  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf297  heat shock protein DnaJ  38.6 
 
 
369 aa  51.2  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.302595  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  38.33 
 
 
385 aa  51.2  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0034  chaperone protein DnaJ  43.1 
 
 
373 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1972  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 
374 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
372 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00181  DnaJ-related protein  26.06 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  45.61 
 
 
381 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0330  chaperone protein DnaJ  39.66 
 
 
379 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1183  chaperone protein DnaJ  36.67 
 
 
377 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000246856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  46.15 
 
 
378 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
379 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  40.68 
 
 
381 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
385 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  44.26 
 
 
376 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0430  chaperone protein DnaJ  37.93 
 
 
379 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0390  chaperone protein DnaJ  37.93 
 
 
386 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1768  chaperone protein DnaJ  47.27 
 
 
380 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  42.37 
 
 
379 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  44.64 
 
 
359 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
384 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>