47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1585 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1585  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 
252 aa  517  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00181  DnaJ-related protein  39.31 
 
 
227 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4188  hypothetical protein  32.63 
 
 
197 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2963  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.96 
 
 
197 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.954883  normal  0.0137072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0565  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.65 
 
 
220 aa  98.6  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  34.48 
 
 
201 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2497  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.93 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.236473  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49040  hypothetical protein  32.07 
 
 
197 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414994  hitchhiker  0.000000057782 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2268  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.61 
 
 
194 aa  86.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0483  heat shock protein DnaJ-like  34.19 
 
 
206 aa  85.5  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000132964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4084  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.75 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000392536  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0725  putative DnaJ-related protein  28.82 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05806  formate dehydrogenase  29.49 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.82 
 
 
225 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000172  DnaJ-related protein  30.34 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3786  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.64 
 
 
219 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2933  heat shock protein DnaJ-like protein  31.33 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.548763  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0728  DnaJ family protein  25.64 
 
 
209 aa  56.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0687  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.13 
 
 
219 aa  55.5  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365833 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1905  hypothetical protein  27.39 
 
 
185 aa  55.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0797  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.17 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0724  heat shock protein DnaJ-like protein  29.41 
 
 
214 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0819  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.38 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3035  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0976  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.93 
 
 
214 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.93 
 
 
214 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831505  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0965  heat shock protein DnaJ domain protein  29.93 
 
 
214 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3397  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.93 
 
 
214 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.330365  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3062  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.67 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0198351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.67 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.634655  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0875  formate dehydrogenase  28.67 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  0.42894 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3716  DnaJ domain-containing protein  27.97 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0995  Dna-J like membrane chaperone protein  40.74 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  40.74 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3109  Dna-J like membrane chaperone protein  40.74 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38015  predicted protein  43.48 
 
 
398 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.964635  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  40.74 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0125  putative heat shock protein DnaJ  43.18 
 
 
225 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2044  DnaJ domain protein  33.96 
 
 
502 aa  43.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.265464  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0133  DnaJ domain-containing protein  33.96 
 
 
502 aa  43.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.805655  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1052  Dna-J like membrane chaperone protein  32.58 
 
 
262 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0982922  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  38.89 
 
 
262 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0983  Dna-J like membrane chaperone protein  32.58 
 
 
262 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.193447  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0372  Dna-J like membrane chaperone protein  32.47 
 
 
283 aa  42.4  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3306  Dna-J like membrane chaperone protein  32.58 
 
 
262 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044478  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3633  Dna-J like membrane chaperone protein  38.89 
 
 
262 aa  42.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0742  hypothetical protein  41.27 
 
 
252 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>